PCR multiplex
Transcript of PCR multiplex
Aplicación de la técnica molecular PCR multiplex para la identificación de especies de peces… y uso de secuenciación masiva de ADN para el mejoramiento genético en acuicultura
PCR multiplex
Especie 1
Especie 2
Especie 3
Especie 4
Especie 5
Tres pasos principales:
• 1) Extracción de ADN
• 2) Amplificación por PCR multiplex
• 3) Electroforesis en gel de agarosa
PCR
PCR
Primers ADN polimerasa
Nucleótidos
A G
C T
ADN molde
PCR
ADN molde ADN polimerasa
Nucleótidos Primers
A G
C T
Desnaturalización a 95°C
PCR
ADN molde ADN polimerasa
Nucleótidos Primers
A G
C T
asociación a 55°C
PCR
ADN molde ADN polimerasa
Nucleótidos Primers
A G
C T
Extensión a 72°C
PCR
Ingredientes principales:
ADN molde ADN polimerasa
Nucleótidos Primers
A G
C T
Electroforesis
Polaca
Nototenia Cola
Austral
Común
Surimi 2009 Surimi 2013
- Errores de etiquetados son muy comunes en alimentos
- Muchos laboratorios dedicados a detectar estos errores
Certificación genética podría otorgar mayor competitividad y valor agregado
Identificación de patógenos
Virus, bacterias, hongos, parásitos, etc
Secuenciación masiva de ADN
RAD-seq: Secuenciación de ADN asociado a sitios de restricción
Sitios Polimórficos
8310 sitios polimórficos
Diferenciación de stocks
P. wiltoni Canal Beagle
P. ramsayi B. Namuncurá
P. ramsayi Golfo San Jorge
Identificación de QTLs
Selección asistida por marcadores (MAS)
Especialmente útil para características difíciles de medir, que exhiben poca heredabilidad y/o se expresan tarde en el desarrollo.
Análisis de QTLs de características importantes para especies de acuicultura
Especie Características
Tilapia Tolerancia a la temperatura, tamaño de cuerpo, resistencia a enfermedades, color, tolerancia a la salinidad, etc. emperature tolerance.
Trucha arcoiris Tolerancia térmica, época de desove, crecimiento, tolerancia a la salinidad, etc.
Salvelinus fontinalis Tasa de crecimeinto, respuesta al estrés.