PCR multiplex

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Aplicación de la técnica molecular PCR multiplex para la identificación de especies de peces… y uso de secuenciación masiva de ADN para el mejoramiento genético en acuicultura

PCR multiplex

Especie 1

Especie 2

Especie 3

Especie 4

Especie 5

Tres pasos principales:

• 1) Extracción de ADN

• 2) Amplificación por PCR multiplex

• 3) Electroforesis en gel de agarosa

PCR

PCR

Primers ADN polimerasa

Nucleótidos

A G

C T

ADN molde

PCR

ADN molde ADN polimerasa

Nucleótidos Primers

A G

C T

Desnaturalización a 95°C

PCR

ADN molde ADN polimerasa

Nucleótidos Primers

A G

C T

asociación a 55°C

PCR

ADN molde ADN polimerasa

Nucleótidos Primers

A G

C T

Extensión a 72°C

PCR

Ingredientes principales:

ADN molde ADN polimerasa

Nucleótidos Primers

A G

C T

Electroforesis

Polaca

Nototenia Cola

Austral

Común

Surimi 2009 Surimi 2013

- Errores de etiquetados son muy comunes en alimentos

- Muchos laboratorios dedicados a detectar estos errores

Certificación genética podría otorgar mayor competitividad y valor agregado

Identificación de patógenos

Virus, bacterias, hongos, parásitos, etc

Secuenciación masiva de ADN

RAD-seq: Secuenciación de ADN asociado a sitios de restricción

Sitios Polimórficos

8310 sitios polimórficos

Diferenciación de stocks

P. wiltoni Canal Beagle

P. ramsayi B. Namuncurá

P. ramsayi Golfo San Jorge

Identificación de QTLs

Selección asistida por marcadores (MAS)

Especialmente útil para características difíciles de medir, que exhiben poca heredabilidad y/o se expresan tarde en el desarrollo.

Análisis de QTLs de características importantes para especies de acuicultura

Especie Características

Tilapia Tolerancia a la temperatura, tamaño de cuerpo, resistencia a enfermedades, color, tolerancia a la salinidad, etc. emperature tolerance.

Trucha arcoiris Tolerancia térmica, época de desove, crecimiento, tolerancia a la salinidad, etc.

Salvelinus fontinalis Tasa de crecimeinto, respuesta al estrés.