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Curso sobre la publicación de datos sobre biodiversidad en la red de GBIF y su aptitud para el uso, edición 2011
Herramientas y recursos para estimar y mejorar la aptitud para el uso (fitness-for-use) de los datos de biodiversidad
Manuel Vargas Del Valle ([email protected])Coordinador de la Unidad de Desarrollos InformáticosInstituto Nacional de Biodiversidad de Costa Rica (INBio)
Buenos Aires (Argentina)30 septiembre 2011
Resumen
Esta presentación es una recopilación de herramientas
y recursos para estimar y mejorar la aptitud para el uso
(fitness-for-use) de los datos sobre biodiversidad.
Esta charla es una traducción de la elaborada en inglés
por Nicolas Noé y Meherzad Romer, y traducida
también al francés por ellos mismos.
Contenidos
Herramientas para metadatos
Herramientas para datos espaciales
Herramientas para datos tabulares
Fuentes de datos
Documentos
Herramientas
Metadatos
IPT(y Dwc-A)
http://code.google.com/p/gbif-providertoolkit/
Geographic coverage metadata in IPT
IPT (y Dwc-A)
http://code.google.com/p/gbif-providertoolkit/
Darwin Core Archive Validatorhttp://tools.gbif.org/dwca-validator/
Darwin Core Archive Validatorhttp://tools.gbif.org/dwca-validator/
Herramientas
Datos espaciales
GeoLocatehttp://www.museum.tulane.edu/geolocate/
• Carga de datos individual o en lote
• Visor con varias capas
• Pueden hacerse correcciones moviendo la localidad o dibujando un polígono
• Se pueden añadir comentarios, ignorar registros y corregir registros similares
• Versiones para Internet, escritorio y trabajo colaborativo
InfoXYhttp://splink.cria.org.br/infoxy?criaLANG=en
• Recibe coordenadas en lat/long
• Puede realizar procesamientos en lote
• Salida: html o MS Excel
spOutlierhttp://splink.cria.org.br/outlier?&setlang=en
spOutlier
Calculadora de georreferenciación
Entrada:Coordenadas,desplazamientos y distancias,fuentes de incertidumbre
Devuelve:CoordinatesEstimados de error
Diva-GIShttp://www.diva-gis.org/
• Software SIG básico
• Gratuito• Orientado a
biología• Vectorial/
Raster• Compatible
con muchos formatos
Quantum GIShttp://www.qgis.org
• Software SIG de propósito general
• Libre• Acepta capas
geográficas de Bds y servicios web
• Mac/Linux/Windows
• Vectorial/Raster• Extendible con
Python• Systema de
agregados• Comunidad de
desarrolladores
Rhttp://www.r-project.org
Lenguaje y ambiente de desarrollo para estadística.
• Análisis y graficación.
• Extendible e integrable con muchas otras aplicaciones libres: SIG, otros lenguajes, ecología, etc.
Herramientas
Datos tabulares
Separador (parser) de nombres
• Atomiza nombres científicos
“Separador de nombres”
Buscador de nombreshttp://tools.gbif.org/namefinder/
• Encuentra nombres científicos
Entradas:• Archivo
• URL
• Texto libre
Buscador de nombres
Marcador de taxonesEntradas:• Url• PDF
Marcador de taxones
Checklist Bank
Output:Higher taxonomy
Input:Scientific Names
Darwin Test
• Mapas fáciles de hacer• Mantiene datos en línea
Tables de Fusión de Google
“Scripting”/lenguajes dinámicos...y el viejo SQL
Fuentes de datos
OpenStreetMap"Wikipedia de mapas"
http://www.openstreetmap.org
Thesauri
• “Checklists”:o Peces : Fishbaseo Animales: Index to Organism Name
(ION)o Mamíferos: Mammal Species of the
World (MSW)o Bacterias: List of Bacteria with
Standing in Nomenclature (LBSN)• ...
Documents
Informe de situación de GBIFPlanes y recomendaciones para mejorar la aptitud de uso de los datos en la red de GBIF
http://www.gbif.org/orc/?doc_id=2777
Inventario BDQ de GBIF de España
http://www.gbif.es/BDQ.php
Centro de recursos en Internet de GBIFhttp://www.gbif.org/orc/
Curso sobre la publicación de datos sobre biodiversidad en la red de GBIF y su aptitud para el uso, edición 2011
Herramientas y recursos para estimar y mejorar la aptitud para el uso (fitness-for-use) de los datos de biodiversidad
Manuel Vargas Del Valle ([email protected])Coordinador de la Unidad de Desarrollos InformáticosInstituto Nacional de Biodiversidad de Costa Rica (INBio)
Buenos Aires (Argentina)30 septiembre 2011
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