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CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA -CONCYT- SECRETARÍA NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA -SENACYT-
FONDO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA -FONACYT- FACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICAS Y FARMACIA UNIVERSIDAD DE SAN CARLOS DE GUATEMALA
INFORME FINAL
“AISLAMIENTO Y MODIFICACIÓN ESTRUCTURAL DE CEMBRANOIDES 2-11 CICLIZADOS DE Briareum asbestinum, PARA POTENCIALIZAR SU
CITOTOXICIDAD Y PROPIEDADES ANTICÁNCER”
PROYECTO FODECYT No. 13-2004
OSCAR MANUEL CÓBAR PINTO Investigador Principal
GUATEMALA, ENERO DE 2009
Facultad de Ciencias Químicas Universidad de San Carlos y Farmacia
AGRADECIMIENTOS
La realización de este trabajo, ha sido posible gracias al apoyo financiero del Fondo Nacional de Ciencia y Tecnología –FONACYT-, otorgado por la Secretaría Nacional de Ciencia y Tecnología –SENACYT- y del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología –CONCYT-, Proyecto FODECYT 13-2004.
OTROS AGRADECIMIENTOS Al equipo de investigación: Lic. Abraham Alejandro Vásquez Mencos, Lic. Jorge Alejandro Torres Flores, Licda. Ruth Yarseny Molina Gonón, Lic. Luis Hugo Santa Cruz Cruz, Br. Ana Lucrecia Gómez López. Al Dr. Abimael D. Rodríguez del Departamento de Química, Facultad de Ciencias Naturales, Universidad de Puerto Rico, Recinto de Río Piedras. A los Laboratorios de los Departamentos de: Química Orgánica, Fisicoquímica, Unidad de Bioensayos del Laboratorio de Investigación en Productos Naturales –LIPRONAT- de la Facultad de Ciencias Químicas y Farmacia de la Universidad de San Carlos de Guatemala y Química de Productos Naturales Marinos de la Universidad de Puerto Rico, Recinto de Río Piedras. Licda. Stella María Cóbar Coronado y Br. Jorge Arroyo Robles, por su apoyo en la elaboración del manuscrito “Survey of 2,11-cyclized cembranoids from Caribbean sources”, publicado en Natural Product Resarch. 2009, 23 (1), 26-43.
CONTENIDO
Página
RESUMEN 01
ABSTRACT 02
PARTE I
I.1 INTRODUCCIÓN 03
I.2 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA 04
I.3 OBJETIVOS E HIPÓTESIS 06
I.4 METODOLOGÍA 07
PARTE II
MARCO TEÓRICO 12
PARTE III
III.1 RESULTADOS 17
III.2 DISCUSIÓN DE RESULTADOS 33
PARTE IV
IV.1 CONCLUSIONES 42
IV.2 RECOMENDACIONES 44
IV.3 REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS 45
IV.4 ANEXOS 49
Extracción, fraccionamiento, separación, purificación de
cembranoides 2,11-ciclizados naturales y síntesis de derivados. 49
Esquema de Aislamiento de Briareum asbestinum. 52
Esquema de Farmacóforos de Cembranoides 2,11-ciclizados naturales. 53
Esquema de Farmacóforos de Cembranoides 2,11-ciclizados 6-ester urocánicos. 55
Esquema de Farmacóforos de Cembranoides 2,11-cicizados 6-glucosidados. 57
Esquema de Farmacóforos de Cembranoides 2,11-ciclizados utilizados como comparación. 58
Survey of 2,11-ciclyzed cembranoids from Caribbean sources. 60
PARTE V
INFORME FINANCIERO 61
1
RESUMEN
Esta investigación generó conocimiento básico sobre las propiedades citotóxicas y
farmacofóricas de cembranoides 2,11-ciclizados (Asbestininos y Briarellinas), naturales y
estructuralmente modificados, aislados del gorgonio caribeño Briareum asbestinum, con
el objetivo de incrementar su citotoxicidad y posteriormente preparar extractos con
propiedades anticáncer, que contengan estos metabolitos secundarios.
La investigación se desarrolló en cuatro fases de trabajo:
En la primera fase se obtiene Briareum asbestinum colectado en aguas de “Isla de
Mona” parte norte de Puerto Rico, por el Dr. Abimael Rodríguez del Laboratorio de
Química de Productos Naturales Marinos, de la Facultad de Ciencias Naturales del
Recinto de Río Piedras de la Universidad de Puerto Rico.
En la segunda fase, se extrae, aisla, purifica e identifica cinco cebranoides 2-11
ciclizados, cuatro con un grupo hidroxilo sobre el carbono 6 de la molécula (Asbestinino
7, Asbestinino 20, 4-deoxyasbestinino G y Briarellina E) y uno con un grupo carbonilo
sobre el carbono 6 de la molécula (Asbestinino 9).
La tercera fase consistió en la síntesis orgánica de un derivado glusosidado (6-
glucósido de Asbestinino 7) y cuatro derivados 6-ester urocánicos (6-ester urocánico de
Asbestinino 7, 6-ester urocánico de Asbestinino 20, 6-ester urocánico de 4-
deoxyasbestinino G y 6-ester urocánico de Briarellina E).
La cuarta fase “estudio de la actividad citotóxica de los productos sintetizados y
de sus propiedades farmacofóricas”, permitió determinar la CL50 (Concentración Letal
Media) contra nauplios de Artemia salina de cuatro metabolitos naturales y cinco
modificados, además de las propiedades farmacofóricas de los cinco cembranoides 2,11-
ciclizados naturales aislados, los cinco modificados estructuralmente y tres utilizados
para fines de comparación.
Se concluye que la CL50 de los derivados 6-ester urocánicos es mayor que la de
aquellos análogos naturales que se encuentra ya reportada en la literatura y determinada
por la misma metodología.
El derivado 6-glucósido de Asbestinino 7 sintetizado mostró una CL50 mucho
mayor (menos tóxico) que los cuatro cembranoides naturales aislados y los cuatro
derivados 6-ester urocánicos sintetizados.
Adicionalmente, todos los cembranoides 2,11-ciclizados estudiados, presentan
propiedades farmacofóricas importantes que los ubica como probables moléculas sujetas
a posteriores estudios.
Estas propiedades se obtuvieron utilizando software de última generación y
comparando los cembranoides 2,11-ciclizados naturales aislados y sus derivados
sintetizados, con tres moléculas que poseen el mismo esqueleto carbonado que son objeto
de estudio en el FDA -Food and Drug Administration- de los Estados Unidos como
medicamentos anticáncer.
Los resultados de esta investigación demostraron la alta potencialidad que tienen
estos metabolitos secundarios de origen marino como probables medicamentos
anticáncer, ya que los derivados modificados estructuralmente, al esterificarlos con ácido
urocánico, demostraron valores de Concentración Letal Media (CL50) en contra de
nauplios de artemia salina superiores a los obtenidos del compuesto utilizado como
2
materia prima, incluso valores que se encuentran a nivel nanomolar (10-9
Molar),
comparables a los obtenidos por Eleuterobina, cembranoide 2,11 ciclizado que se
encuentra en estudios de Fase Clínica II como medicamento anticáncer en el FDA de los
Estados Unidos de América.
Se elaboró una extensa revisión bibliográfica sobre este tipo de compuestos, que
generaron una publicación científica en la revista arbitrada “Natural Product Research”
de Taylor & Francis Editores; Oscar M. Cóbar. Survey of 2,11-cyclized cembranoids
from Caribbean sources. Natural Product Research. 2009, 23 (1), 26-43. De esta forma, se contribuye con las líneas de investigación sobre “Uso de
Productos Naturales y Determinación de Principios Activos de la Comisión Técnica
Intersectorial de Salud, Estudios sobre Especies Silvestres de Flora y Fauna” de la
Comisión Intersectorial de Medio Ambiente y la generación de conocimiento básico en
Química Orgánica de la Comisión de Ciencias Básicas del Sistema Nacional de Ciencia y
Tecnología, Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología y del Sistema de Investigación de
la Universidad de San Carlos de Guatemala, con probable aplicación directa a la salud de
los guatemaltecos.
ABSTRACT
Five 2,11-ciclized cembranoids was isolated from the gorgonian Briareum
asbestinum collected at Mona island, North of Puerto Rico (Asbestinins 7, 9, 20, 4-
deoxyasbestinin G and Briarellin E), four 6-ester urocanic cembranoids (6-ester urocanic
of Asbestinin 7, 6-ester urocanic of Asbestinin 9, 6-ester urocanic of 4-deoxyasbestinin G
and 6-ester urocanic of Briarellin E) and one 6-glucosyde cembranoid (6-glucosyde of
Asbestinin 7) was synthesized.
Four natural compounds (Asbestinin 7, Asbestinin 20, 4-deoxyasbestinin G and
Briarellin E) and all the four 6-ester urocanic synthetic cembranoids showed CL50 values
against A. salina at nanomolar level. The later comparable with those of Eleutherobin and
more potent that their natural homologues.
The CL50 showed by the 6-glycoside of Asbestinin 7 was at micromolar level, one
thousand less potent that its 6-ester urocanic and natural homologues.
The principal pharmacophoric properties was calculated for all the five natural
compounds isolated, the five synthesized and three natural 2,11 cyclized cembranoids of
the Sarcodyctin Class for comparison purposes.
An extensive bibliographic revision was performed on 2,11 cyclized cembranoids
literature, that generate a scientific paper published in Natural Product Research of
Taylor & Francis Editors; Oscar M. Cóbar. Survey of 2,11-cyclized cembranoids from
Caribbean sources. Natural Product Research. 2009, 23 (1), 26-43.
3
PARTE I
I.1 INTRODUCCIÓN
Producir una cantidad adecuada y sustentable de metabolitos secundarios
bioactivos, para su posterior estudio de actividad biológica y uso medicinal es uno de los
principales retos en el estudio de la química de los invertebrados marinos.
El porcentaje de rendimiento de estos compuestos orgánicos, cuando se aislan
directamente del organismo que los produce, es bajo, obteniéndose entre 0.001 y 0.01%
de peso seco del organismo productor (10 mg de compuesto por Kg de peso seco)
(Wright, A.E. 1998).
La Síntesis Orgánica muy a menudo es inaccesible, debido a la complejidad de las
estructuras de estos metabolitos, lográndose algunas síntesis totales con rendimientos
globales del 2-3% en el mejor de los casos y sumamente costosas para su aplicación a
nivel comercial.
Se ha reportado a la fecha la síntesis de tres cembranoides 2,11-ciclizados
del Caribe Mesoamericano, Briarellinas E y F (Corminboeuf, O. et. al. 2003) y 4-
deoxyasbestinino D (Crimmins, M.T.; Ellis, J.M. 2005), obteniéndose en un 1.5-2.0 % de
rendimiento.
Experimentalmente han existido dificultades para el crecimiento de invertebrados
marinos fuera de su hábitat natural, sin embargo existen algunos ejemplos exitosos
(Ojima, I. et. al. 1999, Munro, M. et. al. 1999, Taglialatela-Scafati, O. et. al. 2002).
La fauna invertebrada marina es especialmente rica en las aguas del Caribe
Mesoamericano, situándose como la segunda barrera de arrecifes más grande del mundo,
detrás de la gran barrera de arrecifes de Australia y por encima de las aguas del Pacífico,
las que son especialmente abundantes cerca de las costas de Okinawa y las islas del Japón
y Filipinas (Faulkner, D.J. 2000).
Debido al estrés a que se ven sometidos estos invertebrados marinos, sésiles y sin
defensas físicas, biosintetizan compuestos orgánicos como mecanismos de defensa para
rechazar a sus depredadores.
Estos metabolitos secundarios poseen estructuras químicas sin precedentes y han
demostrado poseer actividad biológica hasta diez veces mayor que los aislados del mundo
terrestre, por lo que su estudio como potenciales fármacos ha crecido durante los últimos
veinte años, reportándose alrededor de 5,000 moléculas nuevas, la mayoría con potente
actividad biológica (Faulkner, D. J. 2000, Newman, D.J.; Cragg, G.M.; 2007, Blunt J.W.
et. al. 2007).
Actualmente el avance de las técnicas espectroscópicas y espectrométricas en la
elucidación estructural de moléculas orgánicas, así como en las técnicas de estudio in
vitro de actividad biológica y modelaje molecular ha permitido el desarrollo actual de
este campo (Blagg, J. 2006, Gassner, N.C. 2007).
Utilizando el conocimiento existente sobre la estructura y química de
cembranoides 2,11-ciclizados del Caribe Mesoamericano, las técnicas de aislamiento y
elucidación estructural, la metodología para determinar su citotoxicidad y propiedades
farmacofóricas, se procedió a generar conocimiento científico que ubica a estas
moléculas de origen marino como potenciales medicamentos anticáncer.
4
I.2 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA
La química de Productos Naturales Marinos es relativamente reciente, aislándose
más de siete mil moléculas, la gran mayoría con estructura química distinta a la
observada en el mundo terrestre y con actividad biológica hasta diez veces mayor.
En la actualidad el estudio de estos compuestos orgánicos aislados del Caribe
mesoamericano ha cobrado auge, teniéndose varios compuestos estudiándose como
probables medicamentos anticáncer en el FDA de los Estados Unidos de América e
incluso con uno de ellos ya comercializándose (Ecteinascidina 743 o Trabectedin®
).
Los cembranoides 2,11-ciclizados están poco estudiados en cuanto a su potencial
actividad biológica, existiendo únicamente el trabajo de Cinel y colaboradores sobre
Eleutherósidos (Cinel, B. et.al. 2000), de su modificación estructural con fines de
potencializar dicha actividad.
Esta investigación está orientada a generar conocimiento básico sobre las
propiedades citotóxicas de cembranoides 2,11 ciclizados (Asbestininos y Briarellinas),
estructuralmente modificados y aislados del gorgonio caribeño Briareum asbestinum, con
el objetivo de incrementar su citotoxicidad y posteriormente preparar extractos con
propiedades anticáncer, que contengan estos metabolitos secundarios.
I.2.1 Antecedentes en Guatemala.
En Guatemala, únicamente la Facultad de Ciencias Químicas y Farmacia realiza
investigación científica sobre la química de invertebrados marinos. El equipo de
investigación, coordinado por el Dr. Oscar Cóbar, ha realizado desde 2,002
investigaciones sobre aislamiento y elucidación estructural de metabolitos secundarios de
corales blandos (Velásquez, P.; Cóbar, O.M. 2006), estudios sobre la actividad biológica
no estudiada de estos metabolitos secundarios (Cóbar, S.M.; Cóbar, O.M. 2006), síntesis
de moléculas aisladas con el objetivo de estudiar su actividad biológica (Cóbar, O.M.;
Vásquez, A.A. 2004) y cultivo de invertebrados marinos para aislar metabolitos
secundarios activos (Cóbar, O.M. et. al. 2006).
Este es el primer trabajo que se realiza, a nivel mundial sobre modificación
estructural de Asbestininos y Briarellinas con fines de potencializar su citotoxicidad.
Adicionalmente es el primer estudio sobre las propiedades farmacofóricas in-vitro
que se realiza a nivel mundial sobre este tipo de compuestos.
I.2.2 Justificación.
El número importante de cembranoides 2,11-ciclizados, aunado a su variada y
sorprendente actividad biológica y aspectos estructurales únicos, las hacen moléculas que
deben ser sujetas a estudios profundos, tanto en su potencial farmacológico, como en el
análisis de la relación entre su estructura y actividad biológica, para planificar su síntesis
orgánica y producción a nivel macro.
I.2.3 Impacto del proyecto.
A mediano plazo puede continuar estudiándose otro tipo de actividad biológica que
permita darle una utilizad biomédica a estos compuestos, que pueden ser patentados al ser
compuestos nuevos (sin precedente en la literatura).
5
A largo plazo se pretende cultivar este gorgonio en ambientes artificiales exsitu,
para que produzca estos metabolitos y tener materia prima para producir los derivados
sintetizados e incluso poder comercializar extractos de B. asbestinum como
medicamentos naturales anticáncer a bajo costo.
No obstante ser un proyecto de investigación básica, su proyección directa al sector
salud del país es alta.
Los resultados de la investigación serán publicados en al menos una revista
arbitrada de carácter internacional, en revistas científicas nacionales y congresos
internacionales sobre la temática.
Las moléculas bioactivas sintetizadas pueden ser patentadas a nivel nacional o
internacionalmente, previo acuerdo entre el CONCYT, la Universidad de San Carlos y
los autores de la investigación.
6
I.3 OBJETIVOS E HIPOTESIS
I.3.1 Objetivos
I.3.1.1 General
Aislar, modificar estructuralmente y determinar la actividad citotóxica de cuatro
cembranoides 2-11 ciclizados hidroxilados, aislados del gorgonio caribeño Briareum
asbestinum.
I.3.1.2 Específicos
I.4.1.2.1 Sintetizar al menos un cembranoide 2-11 ciclizado glucosidado mediante la
reacción de O-glicosidación.
I.4.1.2.2 Sintetizar cuatro cembranoides 2-11 ciclizados ester-urocánicos mediante la
reacción de esterificación.
I.4.1.2.3 Determinar la actividad citotóxica de los derivados de los cembranoides 2-11
ciclizados sintetizados.
I.4.1.2.4 Comparar la actividad citotóxica reportada de los cembranoides 2-11 ciclizados
naturales con la obtenida de los derivados de cembranoides 2-11 ciclizados.
I.3.1.3 Hipótesis
Los cembranoides 2,11-ciclizados estructuralmente modificados poseen mayor actividad
citotóxica que los de origen natural.
7
I.4 METODOLOGIA
I.4.1 Diseño, población a estudiar y muestra.
I.4.1.1 Universo.
Se selecciona el gorgonio caribeño Briareum asbestinum, al conocerse su
composición de cembranoides 2-11 ciclizados, la metodología extractiva y la ubicación
de poblaciones de este invertebrado marino en el área de la costa atlántica guatemalteca y
del Caribe mesoamericano.
I.4.1.2 Población.
Aproximadamente 0.5 kg de peso seco de especímenes de Briareum asbestinum.
I.4.1.3. Obtención, procesamiento y transporte de la muestra de material a estudiar.
El organismo fue colectado en aguas de la Isla de Mona, Puerto Rico en 1994, a
10-15 metros de profundidad utilizando buceo, coordenadas 18º03´19.05´´ Norte y
67º45´32.00´´ Oeste, identificado por el Dr. Abimael Rodríguez.
La muestra se colocó en bolsas plásticas inmediatamente luego de colectadas y
colocadas en hieleras equipadas con hielo seco (-10oC), transportadas inmediatamente al
laboratorio.
Se procede a su liofilización (LABCONCO® de 12 litros de capacidad) para
separar el agua de mar y se pesa.
I.4.1.4. Modelo de muestreo.
Se utilizó un modelo de tipo estratificado, preferencial y por conveniencia.
Los estratos (asociaciones del gorgonio aparentemente homogéneas entre sí) se
definieron por exploraciones de buceo previas y preliminares en la expedición de colecta.
I.4.1.5.Preparación de extracto crudo.
Luego del proceso de liofilización, el organismo seco, es macerado
exhaustivamente en CHCl3/MeOH (1:1), hasta obtenerse aproximadamente 10 litros de
extracto crudo.
El extracto fluido se concentra a presión reducida a una temperatura inferior a los
45°C utilizando un evaporador rotatorio (Buchi® modelo R215), se elimina todo el
solvente utilizando una bomba de alto vacío y se pesa.
Los extractos orgánicos, fracciones, cembranoides 2,11-ciclizados naturales aislados
y sintetizados, fueron procesados en el Laboratorio de Investigación en Productos
Naturales Marinos de la Universidad de Puerto Rico, Recinto de Río Piedras, Puerto
Rico, con ubicación en 18º24´07.79´´ Norte y 66º03´00.87´´ Oeste, a 30 MSNM y una
temperatura media de 28oC y Laboratorio de Investigación de Productos Naturales de la
Facultad de Ciencias Químicas y Farmacia de la Universidad de San Carlos de
Guatemala, ubicado en 14º36´03.55´´ Norte y 99º33´45.40´´ Oeste, a 1517 MSNM y
temperatura media de 23 oC.
8
I.4.1.6. Preparación de extractos orgánicos.
El extracto crudo seco, se suspende en agua y somete a extracción líquido/líquido con
n-hexano, luego CHCl3 y finalmente MeOH.
Se utilizan solventes grado reactivo, realizándose 4 o 5 extracciones con cada uno
I.4.2 Aislamiento de asbestininos y briarellinas (Cóbar, O.M. 1996).
I.4.2.1 Separación por Cromatografía de Exclusión de Tamaño.
El extracto n-hexánico se somete a cromatografía en columna utilizando
Biobeads® como fase estacionaria y tolueno como fase móvil. Se obtienen cuatro
fracciones, monitoreadas por cromatografía en capa fina utilizado acetato de etilo/n-
hexano (7:3) como fase móvil, siendo las fracciones 3 y 4 las ricas en Asbestininos
(Rodríguez, et. al. 1994). El extracto clorofórmico es rico en Briarellinas y Briareinas
(Rodríguez A.D.; Cóbar, O.M. 1995a).
I.4.2.2 Aislamiento y purificación vía Cromatografía en Columna y Cromatografía
Líquida de Alta Resolución –HPLC-.
Las fracciones 3 y 4 provenientes de la etapa anterior se someten a cromatografía
en columna utilizando Sílica Gel G como fase estacionaria y n-hexano/acetato de etilo
(7:3) como fase móvil. De ser necesario se purifica via HPLC (Shimadzu® modelo LC 20
AT) utilizando el mismo sistema de solventes. El extracto clorofórmico se fracciona por
el mismo método, utilizando y purifica utilizando n-hexano/acetato de etilo (8:2) y
purifica vía HPLC, utilizando MeOH/H2O (97:3 hasta 90:10 de ser necesario) en
columna de fase reversa ODS (Alltech 250 mm X 4.6 mm, tamaño de partícula de 5 m).
I.4.2.3 Identificación de cembranoides 2,11-ciclizados aislados.
Las fracciones puras obtenidas, se someten a Resonancia Magnética Nuclear de
Protón y de Carbono trece (Espectrómetro Bruker®
multinuclear modelo DRX 500,
utlizando CDCl3 como solvente) para identificarlos (Rodríguez, A.D. et. al. 1994,
Rodríguez, A.D.; Cóbar, O.M. 1995a; Rodríguez A.D.; Cóbar, O.M. 1995b).
Los compuestos obtenidos que posean un grupo hidroxilo en el carbono 6, se
utilizarán para su derivatización.
I.4.3 Modificación estructural de asbestininos y briarellinas.
I.4.3.1 Glucosidación (Toshima, K.; Tatsuta, K. 1993, Nicolau, K.; Mitchell, H. 2001,
Euzen, R. et. al. 2007).
I.4.3.1.1 Benzoilación de Asbestinino 7 (Reich, M. 2001).
60 mg de Asbestinino 7 se disuelven en una mezcla de 2.5 mL de anhidrido
benzoico disuelto en n-hexano, 2.0 mL de DCC y 2.0 mL de DMAP.
La mezcla se agita a temperatura ambiente durante 48 horas y luego remueve el
solvente por rotaevaporación.
El residuo es particionado entre agua 2.0 mL y éter dietílico 2.0 mL, se separa la
fase orgánica.
9
La fase acuosa es nuevamente particionada con 2.0 mL de éter dietílico y
combinan las fracciones orgánicas.
Las fracción orgánica combinada se rotaevapora y deseca sobre sulfato de
magnesio.
Se caracteriza el producto por su punto de fusión, 1H-RMN y peso molecular.
Se espera obtener 48.0 mg de Asbestinino 7-6-benzoilado (80% de rendimiento de
la reacción).
I.4.3.1.2 Glucosidación de Asbestinino 7-6-benzoilado.
54 mg (1 mmol) de 2,3,4,6-tetra-O-bencill-glucopiranosa (obtenida de Fluka AG,
Buchs, Suiza), 17 mg (005 mmol) de sulfato ácido de tetrabutilamonio y 34 mg (6 mmol)
de hidróxido de potasio finamente dividido, se disuelven en 15 ml of dietoxymetano y
enfría a 0° C.
A esta temperatura, 35 mg (0.06 mmol) of Asbestinino 7-6-benzoilado se añaden
a la mezcla, la cual se agita por 1 hora vigorosamente. Se añaden luego 15 mL de
benceno, se filtra el precipitado y evapora a sequedad.
El sólido se mezcla con una solución de 10 mL de agua y 5 mL de etanol,
añadiéndosele 10 mL de KOH al 50% y reflujado durante 8 horas.
La mezcla se enfría a 0oC, se lleva a pH 8 con HCl al 10% y se elimina el solvente
por alto vacío.
El residuo es mezclado con 15 mL de agua y 20 mL de acetato de etilo,
llevándose la fase acuosa a pH 5 agitándolo con HCl al 10%.
Se separa la fase orgánica y la fase acuosa se extrae una vez más con 10 mL de
acetato de etilo y combina con la fase orgánica.
La fase orgánica combinada se seca con sulfato de magnesio y evapora el
solvente.
El residuo se somete a Cromatografía en Columna utilizando Silica Gel G 60
como fase estacionaria y diclorometano/n-hexano/etanol (20:8:2).
El producto obtenido se concentra por rotaevaporación y obtiene el producto
sólido.
Se determina su punto de fusión, 1H-RMN y obtiene el peso molecular para
identificar el compuesto.
I.4.3.2 Esterificación con ácido urocánico (Tenakado, D.; Oriyama, D. 2006, Reich, M.
2001).
Aproximadamente 30 mg del asbestinino o briarellina correspondiente se disuelven
en una mezcla de 2.5 mL de ácido urocánico, 2.0 mL de DCC y 2.0 mL de DMAP se
agitan a 25oc durante 48 horas.
El exceso de reactivo se remueve por rotaevaporación y el residuo obtenido se
particiona entre agua y éter dietílico.
Los extractos etéreos combinados se desecan sobre Na2SO4 para obtener el éster
urocánico correspondiente.
10
I.4.3.3 Elucidación estructural de Cembranoides 2,11-ciclizados derivatizados
(Cóbar, O.M. 1996).
Los cembranoides 2,11-ciclizados derivatizados, se someten a Resonancia
Magnética Nuclear de Protón y de Carbono 13 para identificarlos para determinar si
efectivamente la reacción se realizó. Se espera modificaciones en ambos espectros,
específicamente señales derivadas de los carbonos de la glucosa y del ácido urocánico,
ubicados ahora en sobre el Carbono 6 del cembranoide.
Adicionalmente se somete a Espectrometría de Masas por Impacto Electrónico para
obtener el peso molecular y su patrón de fragmentación para confirmar su estructura.
I.4.3.4 Determinación de la Actividad Citotóxica de Cembranoides 2,11-ciclizados
Derivatizados (CYTED 1995).
Los derivados sintetizados son sometidos a pruebas de actividad citotóxica,
utilizando la metodología estándar del Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología
para el Desarrollo (CYTED) de 1995, este ensayo permite la estimación de la
citotoxicidad en nauplios de A. salina mediante la evaluación de al menos 3 niveles de
dilución del extracto y las fracciones a ensayar. La técnica consiste en la preparación de
un medio salino adecuado, la colocación de huevos del crustáceo en dicho medio y su
eclosión, que se resume de la siguiente manera:
Se transfiere la mayor cantidad de nauplios vivos a un erlenmeyer con medio
salino fresco.
Se preparan para cada sustancia de prueba 3 niveles de dilución (1000, 500 y 250
µg/mL) y se colocan por triplicado en 9 pozos de la microplaca, haciendo un volumen
total por pozo de 100 µL de solución a ensayar.
Posteriormente se agregan a cada pozo 100 µL de medio salino conteniendo de
10-15 nauplios y 100 µL de medio salino.
Se utilizan 3 pozos como controles negativos los que se preparan en forma
similar, utilizando como sustancia de prueba el medio de disolución de los extractos.
Luego de 24 horas, se procede a contar el número de sobrevivientes en cada
dilución, del que por diferencia con el valor inicial, se calcula el número de decesos
observados.
La Concentración Letal Media (CL50) se calcula mediante una regresión no
paramétrica utilizando el programa “Trimmed Spearman-Karber Method”, versión 1.5.
I.4.3.5 Modelaje Molecular y Propiedades Farmacofóricas de Cembranoides 2,11-
ciclizados Derivatizados.
Se realizan los estudios de Modelaje Molecular de los cembranoides 2,11-
ciclizados aislados y derivatizados:
Asbestinino 9, 4-deoxyasbestinino G y 6-ester urocánico de 4-deoxyasbestinino
G, Briarellina E y 6-ester urocánico de Briarellina E, Asbestinino 20 y 6-ester urocánico
de Asbestnino 20, Asbestinino 7, 6-ester urocánico de Asbestinino 7 y 6-glucósido de
Asbestinino 7.
Ellos fueron minimizados utilizando el Algoritmo RM1, re-parametrización de
AM1 contenido en el Programa Spartan for Windows 2006 (G.B. Rocha, R.O. Freire, A.
Simas and J.J.P. Stewart, J.Computational Chem. 2006, 27, 1101) de Wavefunction Inc.
11
De cada uno se calcularon, entre otros, los siguientes parámetros:
Energía de Formación
Momento Dipolo
Distancia entre cada uno de los enlaces de la molécula
Distancia espacial entre átomos de la molécula
Densidad Superficial
Highest Occupied Molecular Orbital -HOMO-
Lowest Occupied Molecular Orbital -LUMO-
Las propiedades farmacofóricas estudiadas de los compuestos citados son:
C log P (Indice de Solubilidad en n-octano)
TPSA (Topological Polar Surface Area)
Número de Aceptores de Protones
Número de Donadores de Protones
Número de Negativos Ionizables
Número de Positivos Ionizables
Relación átomos/enlaces
Número de Anillos
Enlaces Rotables
Atomos Aromáticos
Estas propiedades se calcularon utilizando los siguientes programas informáticos:
LigandScout v. 1.03, (No. de Serie: 14520307730892251293) de Inte:Ligand S.A.
basado en: G. Wolber and T. Langer. LigandScout: 3-D Pharmacophores Derived
from Protein-Bound Ligands and Their Use as Virtual Screening Filters J. Chem.
Inf. Model; 2005; 45(1); 160-169.
Peter Ertl, Bernhard Rohde, Paul Selzer. Fast Calculation of Molecular Polar
Surface Area Directly from SMILES. Novartis Pharma AG, ChemInformatics,
CH-4002, Basel, Switzerland. Basado en: Ertl, P., Rohde, B., Selzer, P. Fast
calculation of molecular polar surface area as a sum of fragment based
contributions and its application to the prediction of drug transport properties. J.
Med. Chem. 2000, 43, 3714-3717.
12
PARTE II
MARCO TEÓRICO
Química de Productos Naturales Marinos
Producir una cantidad adecuada y sustentable de metabolitos secundarios
bioactivos, para su posterior estudio de actividad biológica y uso medicinal es uno de los
principales retos en el estudio de la química de los invertebrados marinos.
El porcentaje de rendimiento de estos compuestos orgánicos, cuando se aislan
directamente del organismo que los produce, es bajo, obteniéndose entre 0.001 y 0.01%
de peso seco del organismo productor (10 mg de compuesto por Kg de peso seco)
(Wright, A.E. 1998).
La Síntesis Orgánica muy a menudo es inaccesible, debido a la complejidad de las
estructuras de estos metabolitos, lográndose algunas síntesis totales con rendimientos
globales del 2-3% en el mejor de los casos y sumamente costosas para su aplicación a
nivel comercial.
Experimentalmente han existido dificultades para el crecimiento de invertebrados
marinos fuera de su hábitat natural, sin embargo existen algunos ejemplos exitosos
(Ojima, I. et. al. 1999, Munro, M. et. al. 1999, Taglialatela-Scafati, O. et. al. 2002).
La fauna invertebrada marina es especialmente rica en las aguas del caribe
Mesoamericano, situándose como la segunda barrera de arrecifes más grande del mundo,
detrás de la gran barrera de arrecifes de Australia y por encima de las aguas del Pacífico,
las que son especialmente abundantes cerca de las costas de Okinawa y las islas del Japón
y Filipinas (Faulkner, D.J. 2000).
Debido al estrés a que se ven sometidos estos invertebrados marinos, sésiles y sin
defensas físicas, biosintetizan compuestos orgánicos como mecanismos de defensa para
rechazar a sus depredadores. Estos metabolitos secundarios poseen estructuras químicas
sin precedentes y han demostrado poseer actividad biológica hasta diez veces mayor que
los aislados del mundo terrestre, por lo que su estudio como potenciales fármacos ha
crecido durante los últimos veinte años, reportándose alrededor de 5,000 moléculas
nuevas, la mayoría con potente actividad biológica (Faulkner, D. J. 2000, Newman, D.J.;
Cragg, G.M.; 2007, Blunt J.W. et. al. 2007).
Actualmente el avance de las técnicas espectroscópicas y espectrométricas en la
elucidación estructural de moléculas orgánicas, así como en las técnicas de estudio in
vitro de actividad biológica y modelaje molecular ha permitido el desarrollo actual de
este campo (Blagg, J. 2006, Gassner, N.C. 2007).
Briareum asbestinum.
Briareum asbestinum (phylum Coelenterata, sub-phylum Cnidaria, clase
Anthozoa, sub-clase Alcyonaria, orden Gorgonacea, sub-orden Scleroxonia, familia
Briareidae, género Briareum, especie asbestinum) es un habitante común de las aguas
poco profundas del Caribe Mesoamericano, en donde se le encuentra en dos morfologías,
incrustada y erecta. Taxonomicamente se le ubica entre los grupos Alcyonacea y
Gorgonacea de octocorales, los que son abundantes en los arrecifes de los océanos
Pacífico y Atlántico respectivamente (Opresko, D.M. 1973, Coll, J.C. 1992, Rodríguez, A.D.
1995). El primer reporte describiendo metabolitos secundarios aislados de un espécimen
caribeño de Briareum asbestinum aparece en 1966 (Hyde, R.W. 1966) en la Disertación
13
Doctoral de R. W. Hyde en la Universidad de Oklahoma, en la que describe una serie de
diterpenos clorinados sin asignar estructuras.
John Faulkner y colaboradores reportan los primeros Asbestininos en 1980
(Stierle, D.B. et. al. 1980) y A. D. Rodríguez y O. M. Cóbar las primeras Briarellinas en
1995 (Rodríguez, A.D.; Cóbar, O.M. 1995).
A la fecha se han reportado 39 Asbestininos, la mayoría (21) aislados por O. M.
Cóbar, todos del Caribe Mesoamericano (Cóbar, O.M. 1996), 29 Briarellinas; 22 por O. M.
Cóbar y A. D. Rodríguez (Rodríguez, A.D.; Cóbar, O.M. 1995, Rodríguez, A.D.; Cóbar, O.M.
1995a, Ospina, C.A. et. al. 2003, Ospina, C.A.; Rodríguez, A.D. 2006) y 7 por Sheu y
colaboradores en aguas taiwanesas.(Wang, G. H. 2001, Wang, G. H. 2002).
En la actualidad sólo existen dos reportes de eunicelinas aisladas de organismos
del Caribe Mesoamericano; Polyanthellin A de Briareum polyanthes de Puerto Rico
(Ospina, C.A. et. al. 2003) y las Sarcodyctinas; Eleutherobin, junto con tres Eleutherósidos
de Eritrhopdium caribaeorum, de aguas del Caribe y cultivado en el Canadá (Taglialatela-
Scafati, O. et. al. 2002).
De estos metabolitos, sesenta y nueve (69) provienen de organismos del caribe
mesoamericano y fueron aislados de Briareum asbestinum (44), Briareum polyanthes
(18) y Erithropodium caribaeorum (7).
Esqueleto de Asbestinino Esqueleto de BriareinaEsqueleto de Eunicelina Esqueletos carbonados de diterpenoides de Briareum asbestinum
Cembranoides 2-11 Ciclizados.
Los cembranoides 2-11 ciclizados de origen marino, son metabolitos secundarios
presumiblemente formados biogeneticamente por la ciclización de una molécula de
cembrano (Stierle, D.B. et. al. 1980, Bernardelli, P.; Paquette, L.A. 1998).
Este grupo de compuestos se divide en cuatro familias; Eunicelinas, Briarellinas,
Asbestininos y Sarcodictinas, cuyo común origen biogenético se resume así:
Ciclización de la molécula del cembrano entre los carbonos 2 y 11, origina el
esqueleto carbonado de las Eunicelinas.
7
16
14
11
6
3
18
3
2
11
Cembrano Eunicelina
14
Posterior oxidación entre los carbonos 3 a 16 y 2 a 9, seguida de ciclización,
produce el esqueleto de Briarellina.
16
14 13
6
7911
O
O
9
BriarellinaEunicelina
1 3
6
11
14
16
7
Transposición subsecuente de metilo entre los carbonos 11 y 12 forma el
esqueleto de Asbestinino.
Asbestinino
O
O
119 7
6
3114
16
Briarellina
O
O
11 9 7
6
3114
16
De igual manera, la oxidación entre los carbonos 4 y 7 del esqueleto de
Eunicelina, seguida de posterior ciclización, origina el esqueleto de las
Sarcodictinas. 7
16
14
11
6
31
Eunicelina
9
O
11
14 13
79
Sarcodictina
4
4
Briarellinas y Asbestininos pueden sufrir posterior ruptura oxidativa entre los
carbonos 6 y 7 para producir las Secobriarellinas y los Secoasbestininos.
16
14 13
6
7911
O
O
Briarellina
16
14 13
6
7911
O
OO
H
O
Seco-briarellina
Seco-asbestinino
O
OO
H
O
11 97
63
114
16
Aabestinino
O
O
11 9 7
6
3114
16
Es esta propuesta biosintética la que se ha tomado como fundamento para
clasificar así a estos compuestos orgánicos, no obstante, existe otro criterio de
clasificación, el que engloba a Eunicelinas, Briarellinas y Sarcodictinas como parte de las
15
Cladielinas (sinónimo para varios autores de Eunicelinas) y a los Asbestininos como el
otro grupo, basado en la estructura del esqueleto carbonado de ambos grupos de
compuestos (Bernardelli, P.; Paquette, L.A. 1998).
Los cembranoides 2-11 ciclizados son metabolitos comunes en diversos géneros
de octocorales (Phylum Coelenterata, Clase Anthozoa, Sub-clase Octocorallia), entre los
que se encuentran Briareum, Eunicella, Cladiella, Solenopodium y Erithropodium entre
otros, poseen estructuras únicas, sin precedente en el mundo terrestre y una variedad de
actividades biológicas (anti-inflamatoria, citotóxica, antitumoral, antiviral e insecticida
entre otras), que los hacen promisorios futuros medicamentos (Coll, J.C. 1992, Rodríguez,
A.D. 1995, Sung P-J; Cheng M-C. 2002). En la actualidad se han reportado más de ciento cincuenta metabolitos de este
tipo, siendo los más abundantes las Eunicelinas, seguido de los Asbestininos, Briarellinas
y Sarcodictinas en su orden (Blunt, J.W. et. al. 2007).
Las Eunicelinas (Cladielinas), fueron los primeros cembranoides 2-11 ciclizados
aislados de un organismo marino, siendo Eunicelina obtenida del gorgonio del
mediterráneo Eunicella estricta en 1968 la primera reportada (Kennard, O. et. al. 1968).
Desde ese año, se han reportado alrededor de 70 Eunicelinas, la mayoría del hemisferio
norte (gran barrera de arrecifes de Australia, el Océano Índico, el Mar Mediterráneo y las
aguas del Pacífico Japonés) con una gran variedad de actividad biológica (citotóxica,
ictiotóxica, hemolítica y anti-inflamatoria, entre otras) (Kennard, O. et. al. 1968, Sung, P-J.;
Chen M-C. 2002).
CH3CH3
O
H
H
OAc
CH2CH3AcO
AcO
OAcH3C
Eunicelina (1) Los primeros Asbestininos (Asbestininos 1 al 5) fueron aislados hasta 1980 de
especimenes de Briareum asbestinum del caribe centroamericano, reportándose que
antagonizan el efecto de la acetilcolina en preparaciones de íleo de ratones de guinea a
niveles de 16 g/mL (Stierle, D.B. et. al. 1980).
En la actualidad se han reportado 39 Asbestininos, todos del caribe
mesoamericano y con actividad biológica poco estudiada, pero altamente citotóxicos en
contra varias líneas celulares cancerosas (Sung, P-J.; Chen M-C. 2002, Blunt, J.W. et. al.
2007).
Asbestinino 1
CH 3
CH 3O O C3H7
O
O
AcOH
HH
H3C
H3C
Las Briarellinas se han aislado en su gran mayoría de especimenes del género
Briareum de aguas del caribe mesoamericano, siendo Briarellina A, en conjunto con
Briarellinas B, C, D y Secobriarellina, las primeras descritas en 1995 (Rodríguez, A.D.;
Cóbar, O.M. 1995a). Se reporta en esta publicación, que Briarellina A posee citotoxicidad
contra células HeLa a valores de IC50 = 20.0 g/mL.
16
La estructura inicial de Briarellina A fue revisada y reasignada como la que se
muestra a continuación (Ospina, C.A. et. al. 2003). Actualmente se han reportado 29
Briarellinas, 22 aisladas de gorgonios del género Briareum del caribe mesoamericano
(Cóbar, O. M. 2000, Sung, P-J.; Chen M-C. 2002, Blunt, J.W. et. al. 2007,).
Seco-briarellina
CH3
H
H3C O CH3
H
O
HCH3HO
O
O H
CHO
H
HH
Briarellina A
CH2
H3C
H
H
CH3O
OOH
O C7H15
O
O
O
HO CH3H
HH
Sarcodictina A, junto con sus congéneres Sarcodictinas B, D, E y F, fue reportada en
1987 de Sarcodictyon roseum del pacífico australiano (D’Ambrosio, M. et. al. 1987)
indicándose que este compuesto posee actividad antitumoral contra una variedad de
células cancerígenas a niveles de IC50 entre 400 y 900 nM e induce polimerización de las
tubulinas y estabilización de los microtúbulos, un mecanismo de acción que actualmente
se encuentra en estudio y es por el que actúa Taxol, comercializado como medicamento
anticáncer con el nombre comercial de Paclitaxel. (Cragg, G. M.; Newman, D. J. 2004).
Actualmente se han reportado 22, la mayoría del pacífico norte y pareciera ser el grupo
que mayor actividad biológica posee, reportándose Eleutherobina con un IC50 entre 10 y
15 nM contra una variedad de células cancerosas, induciendo también la polimerización
de tubulinas y la estabilización de los microtúbulos (Boik, J. 2001, Sung, P-J.; Chen M-C.
2002, Blunt, J.W. et. al. 2007, Altmann, K-H.; Gertsch, J. 2007).
O
CH3
CH3 CH3
CH3
OHCOOMe
O
O
N
N
CH3
Sarcodictina A
17
PARTE III
III.1 RESULTADOS
III.1.1 Obtención de la Muestra
El organismo fue colectado en aguas de la Isla de Mona, Puerto Rico en 1994, a
10-15 metros de profundidad utilizando buceo, identificado por el Dr. Abimael
Rodríguez.
La muestra se colocó en bolsas plásticas inmediatamente luego de colectadas y
colocadas en hieleras equipadas con hielo seco (-10oC), transportadas inmediatamente al
laboratorio.
Se procede a su liofilización para separar el agua de mar y pesadas (peso seco del
espécimen).
Una muestra del espécimen se encuentra depositado en el Laboratorio de Química
de Productos Naturales Marinos de la Universidad de Puerto Rio, Recinto de Río Piedras,
bajo el número BAPR04-1.
III.1.2 Obtención del Extracto Crudo.
Luego del proceso de liofilización, se obtienen 480 g de peso seco de Briareum
asbestinum, que es macerado exhaustivamente en CHCl3/MeOH (1:1), hasta obtener
aproximadamente 10 litros de extracto crudo.
El extracto fluido se concentra a presión reducida a una temperatura inferior a los
45°C utilizando un evaporador rotatorio, se elimina todo el solvente utilizando una
bomba de alto vacío, se pesa, obteniéndose 57.4 g (11.96%) de extracto crudo (BAM)
III.1.3 Obtención de Extractos Orgánicos
Los 57.4 gramos de extracto crudo, se suspenden en agua y someten a extracción
líquido/líquido con n-hexano, luego CHCl3 y finalmente MeOH.
Se obtienen 42.62 g de extracto n-hexánico -BAMH- (74.25%), 8.07 g de extracto
clorofórmico -BAMC- (14.07%) y 6.70 g de extracto metanólico -BAMM- (11.68%).
III.1.4 Fraccionamiento de Extracto n-hexánico
III.1.4.1 Fraccionamiento por Cromatografía de Exclusión de Tamaño.
40.0 g del extracto n-hexánico se disuelve en tolueno y fracciona por exclusión de
tamaño utilizando BIOBEADS SX-2® como fase estacionaria, obteniéndose cuatro
fracciones: BAMH1 (12.50 g, 31.2%), BAMH2 (8.39 g, 20.9%), BAMH3 (6.98 g,
17.4%) y BAMH4 (12.13 g, 30.5%).
Las cuatro fracciones sometidas a estudio de Cromatografía en Capa Fina -TLC-,
utilizando como fase estacionaria Sílica Gel G 60 (Merck, precortadas) y fase móvil n-
hexano/acetato de etilo (70:30) determina que la fracción BAMH4 es la de mayor
contenido en cembranoides 2,11-ciclizados, por lo que se procedió a su fraccionamiento.
18
III.1.4.2 Fraccionamiento por Cromatografía en Columna y Cromatografía Líquida
de Alta Resolución -HPLC-
12.0 g de la fracción BAMH4 se someten a fraccionamiento por Cromatografía en
Columna utilizando Sílica Gel (Alltech) de tamaño de partícula entre 35 y 75
micrómetros como fase estacionaria y EtOAc/n-hexano (3:7) grado analítico como fase
móvil. (Anexo 1) Se obtienen 21 fracciones, las cuales se analizaron por Cromatografía
en Capa Fina, utilizando Sílica Gel G 60 como fase estacionaria y n-hexano/acetato de
etilo (70:30) como fase móvil. (Anexo 2)
Adicionalmente a las fracciones de mayor pureza se les realizó estudios de 1H-
RMN y 13
C-RMN para determinar las que poseen los cembranoides 2,1-ciclizados a
aislar y purificar.
III.1.5 Aislamiento y Elucidación Estructural de Cembranoides 2,11-ciclizados.
III.1.5.1 Aislamiento y Elucidación Estructural de Asbestinino 9.
La Fracción BAMH4.11 (120 mg) es sometida a HPLC utilizando MeOH/H2O
(9:1), como fase móvil y Columna ODS, como fase estacionaria, obteniéndose 48 mg de
analíticamente puro Asbestinino 9.
La identificación de la molécula se obtiene por sus señales de 1H-RMN ( 2.28,
H23; 0.22, Me 24; 5.26, H11; 5.23, H19a; 5.14 H19b) y de 13
C-RMN ( 176.3,
C21; 36.5, C22; 18.4, C23; 13.7, Me24; 146.7, C7; 114.0, C19; 72.7, C11;
206.6, C6).
Figura 1. Estructura de Asbestinino 9
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
11
6
2119
7 O
III.1.5.2 Aislamiento y Elucidación Estructural de 4-Deoxyasbestinino G.
La Fracción BAMH4.20 es fraccionada sucesivamente vía Cromatografía en
Columna utilizando Si Gel G 60 como fase estacionaria y n-hexano/EtOAc (80:20) como
fase móvil, la tercera fracción produce 80 mg de analíticamente puro 4-deoxyasbestinino
G.
La identificación de la molécula se obtiene por sus señales de 1H-RMN ( 0.97, Me
24; 5.26, H11; 5.30, H19a; 5.16 H19b; 4.22, H6) y de 13
C-RMN ( 173.7, 146.4,
C7; 115.8, C19; 73.2, C11).
Figura 2. Estructura de 4-deoxyasbestinino G
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
O
OH
O
11
6
2119
7
19
III.1.5.3 Aislamiento y Elucidación Estructural de Briarellina E.
La Fracción BAMH4.12 (65 mg) es sometida a HPLC utilizando MeOH/H2O (8:2),
como fase móvil y Columna ODS Ultrasphere Si-Gel, como fase estacionaria,
obteniéndose 34 mg de analíticamente pura Briarellina E.
La identificación de la molécula se obtiene por sus señales de 1H-RMN ( 1.31,
Me20; 0.81, Me 17; 1.58, H15; 5.17, H4; 4.50, H9; 4.18, H6; 5.47, H19a;
5.17 H19b) y de 13
C-RMN ( 175.0, C21; 67.3, C16; 71.6, C4; 36.4, C15; 24.8,
C13; 10.3, Me17; 148.2, C7; 115.1, C19; 71.6, C11; 74.0, C6).
Figura 3. Estructura de Briarellina E
O
O
CH2
H3CCH3
H
HH
H
H
OH
H3COH
O
O
11
1516
421
6
7
19
9
III.1.5.4 Aislamiento y Elucidación Estructural de Asbestinino 20.
La Fracción BAMH4.13 (72 mg) es sometida a HPLC utilizando MeOH/H2O
(75:25), como fase móvil y Columna ODS Ultrasphere Si-Gel, como fase estacionaria y
luego Cromatografía en Columna utilizando Si Gel G 60 como fase estacionaria y n-
hexano/EtOAc (80:20) como fase móvil obteniéndose 38 mg de analíticamente puro
Asbestinino 20.
La identificación de la molécula se obtiene por sus señales de 1H-RMN ( 2.07,
Me22; 4.09, H6; 5.38, H11; 5.17, H4; 5.20, H19a; 4.89 H19b) y de 13
C-RMN (
171.0, C21; 29.0, C4; 148.0, C7; 114.4, C19; 73.6, C11; 75.3, C6).
Figura 4. Estructura de Asbestinino 20
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
OH
O
O
2122
116
19
7
4
III.1.5.5 Aislamiento y Elucidación Estructural de Asbestinino 7.
La Fracción BAMH4.18 (190 mg) es sometida a HPLC utilizando MeOH/H2O
(93:07), como fase móvil y Columna ODS Ultrasphere Si-Gel, como fase estacionaria
obteniéndose 96 mg de analíticamente puro Asbestinino 7.
La identificación de la molécula se obtiene por sus señales de 1H-RMN ( 2.07,
Me22; 4.53, H6; 5.37, H11; 5.52, H4; 5.31, H19a; 5.14 H19b) y de 13
C-RMN (
171.0, C21; 173.0, C23; 69.5, C4; 144.4, C7; 117.2, C19; 73.6, C11; 87.0,
C6).
20
Figura 5. Estructura de Asbestinino 7
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
OH
O
O
11 7
19
6
4
21
23
III.1.6 Glucosilación de 4-deoxyasbestinino G.
III.1.6.1 Benzoilación de Asbestinino 7.
Como producto de la esterificación con anhídrido benzoico de Asbestinino 7, se
obtienen 42 mg (70 % de rendimiento) de Asbestinino 7-6-benzoilado.
El producto posee un Punto de Fusión de 398 ± 2 oC con descomposición.
Se observan cinco señales de 1HRMN adicionales al de Asbestinino 7 en la región
de 6.95-7.42 ppm, correspondiendo al anillo aromático de la fracción del ester benzoilo y
la señal correspondiente al H6, es desplazada a campo bajo de 4.56 ppm a 5.42 ppm,
típico de haber sufrido esterificación dicha posición hidroxilada.
El Espectro de Masas de Impacto Electrónico, muestra un peso molecular de 624
umas.
Esquema 1. Benzoilación de Asbestinino 7
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
O
O
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
OH
O
O
1. DCC2. DMAP3. Anhidrido Benzoico
III.1.6.2 Glucosidación de Asbestinino 7-6-benzoilado.
Como producto de la reacción de glucosidación del Asbestinino benzoilado, se
obtienen 7.0 mg del Asbestinino 7-6-glucosidado (0.01 mmol, 17% de rendimiento).
El producto se descompone arriba de 225 oC.
Se observan seis señales de 1HRMN adicionales al de Asbstinino 7 en la región de
3.35 a 3.62 ppm que corresponden a los protones hidroxilados del azúcar y una a 4.57
ppm que corresponde al protón anomérico. La señal correspondiente al H6, es desplazada
a campo alto de 4.56 ppm a 3.26 ppm, típico de haber sufrido alquilación dicha posición.
El Espectro de Masas de Impacto Electrónico, muestra un peso molecular de 682
umas.
21
Esquema 2. Glucosidación de Asbestinino 7-6-benzoilado
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
O
O OH
H
HOH
H
HHO
H
OH
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
O
O
1. 2,3,4,6-tetra-O-bencil
glucopiranosa2. (Bu4N)SO4H
3. KOH
4. HCl
III.1.7 Urocanización de 4-deoxyasbestinino G, Briarellina E, Asbestinino 20 y
Asbestinino 7.
III.1.7.1 Urocanización de 4-deoxyasbestinino G.
Como resultado de la reacción de esterificación de 35 mg (0.08 mmol) de 4-
deoxyasbestinino G con ácido urocánico, se obtienen 27 mg (0.05 mmol, 62.5% de
rendimiento) de 6-ester urocánico de 4-deoxyasbestinino G.
Por la poca cantidad de compuesto obtenido y la descomposición observada en el
derivado glucosidado de Asbestinino 7, no se procedió a tomar su Punto de Fusión.
Se observan cuatro señales de 1HRMN adicionales al de 4-deoxiyasbestinino G, una
en la región de 6.0 ppm que corresponde a uno de los protones vinílicos de la cadena
alifática del éster urocánico y tres a 7.1-7.6 ppm que corresponden al otro protón vinílico
y los protones del anillo nitrogenado del éster. La señal correspondiente al H6, es
desplazada a campo bajo de 4.22 ppm a 5.18 ppm, típico de haber sufrido esterificación
dicha posición.
El Espectro de Masas de Impacto Electrónico, muestra un peso molecular de 526
umas.
Esquema 3. Esterificación con Acido Urocánico de 4-deoxyasbestinino G
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
O
OH
O
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
NH
N
O
1. DCC2. DMAP3. Acido Urocánico
III.1.7.2 Urocanización de Briarellina E.
Como resultado de la reacción de esterificación de 30 mg (0.06 mmol) de
Briarellina E con ácido urocánico, se obtienen 22 mg (0.036 mmol, 61.0% de
rendimiento) de 6-ester urocánico de Briarellina E.
Por la poca cantidad de compuesto obtenido y la descomposición observada en el
derivado glucosidado de Asbestinino 7, no se procedió a tomar su Punto de Fusión.
Se observan cuatro señales de 1HRMN adicionales a las de Briarellina E, una en la
región de 6.2 ppm que corresponde a uno de los protones vinílicos de la cadena alifática
del éster urocánico y tres a 7.2-7.8 ppm que corresponden al otro protón vinílico y los
protones del anillo nitrogenado del éster. La señal correspondiente al H6, es desplazada a
22
campo bajo de 4.18 ppm a 5.24 ppm, típico de haber sufrido esterificación dicha
posición.
El Espectro de Masas de Impacto Electrónico, muestra un peso molecular de 598
umas.
Esquema 4. Esterificación con Acido Urocánico de Briarellina E
1. DCC2. DMAP3. Acido Urocánico
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
OH
H3COH
O
O
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
O
H3COH
O
O
NHN
O
III.1.7.3 Urocanización de Asbestinino 20.
Como resultado de la reacción de esterificación de 25 mg (0.066 mmol) de
Asbestinino 20 con ácido urocánico, se obtienen 17 mg (0.034 mmol, 52.0% de
rendimiento) de 6-ester urocánico de Asbestinino 20.
Por la poca cantidad de compuesto obtenido y la descomposición observada en el
derivado glucosidado de Asbestinino 7, no se procedió a tomar su Punto de Fusión.
Se observan cuatro señales de 1HRMN adicionales al de Asbestinino 20, una en la
región de 6.1 ppm que corresponde a uno de los protones vinílicos de la cadena alifática
del éster urocánico y tres a 7.1-7.8 ppm que corresponden al otro protón vinílico y los
protones del anillo nitrogenado del éster. La señal correspondiente al H6, es desplazada a
campo bajo de 4.09 ppm a 5.14 ppm, típico de haber sufrido esterificación dicha
posición.
El Espectro de Masas de Impacto Electrónico, muestra un peso molecular de 498
umas.
Esquema 5. Esterificación con Acido Urocánico de Asbestinino 20
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3COH
O
O
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3CO
O
O
O
NH
N1. DCC2. DMAP3. Acido Urocánico
III.1.7.4 Urocanización de Asbestinino 7.
Como resultado de la reacción de esterificación de 50 mg (0.096 mmol) de
Asbestinino 7 con ácido urocánico, se obtienen 46 mg (0.071 mmol, 74.0% de
rendimiento) de 6-ester urocánico de Asbestinino 7.
Por la poca cantidad de compuesto obtenido y la descomposición observada en el
derivado glucosidado de este mismo compuesto, no se procedió a tomar su Punto de
Fusión.
Se observan cuatro señales de 1HRMN adicionales al de Asbestinino 7, una en la
región de 6.0 ppm que corresponde a uno de los protones vinílicos de la cadena alifática
23
del éster urocánico y tres a 7.0-7.6 ppm que corresponden al otro protón vinílico y los
protones del anillo nitrogenado del éster. La señal correspondiente al H6, es desplazada a
campo bajo de 4.53 ppm a 5.19 ppm, típico de haber sufrido esterificación dicha
posición.
El Espectro de Masas de Impacto Electrónico, muestra un peso molecular de 640
umas.
Esquema 6. Esterificación con Acido Urocánico de Asbestinino 7
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
OH
O
O
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
O
NH
N
O
1. DCC2. DMAP3. Acido Urocánico
III.1.8 Determinación de la actividad citotóxica de Cembranoides 2,11-ciclizados
derivatizados.
La interpretación de los resultados se realizó mediante inferencia estadística,
haciendo uso de técnicas no paramétricas, donde se utilizó para la estimación de
concentraciones inhibitorias al 50% (CI50) el método de Trimmed Spearman-Karber,
versión 1.5, para la actividad citotóxica en nauplios de A. salina.
Se determinó la actividad citotóxica contra A. salina de 6-glucósido de asbestinino
7, 6-ester urocánico de 4-deoxyasbestinino G, 6-ester urocánico de Briarellina E, 6-ester
urocánico de Asbestinino 20 y 6-ester urocánico de Asbestinino 7 los que fueron
evaluados por quintuplicado agregando 100 µL del extracto disuelto y 100 µL del agua
de mar con 10-15 nauplios (concentración final de 1mg/mL), utilizando como control
negativo 100 µL de agua de mar y 100 µL de agua de mar con 10-15 nauplios.
III.1.8.1 Tamizaje de la actividad citotóxica de Cembranoides 2,11-ciclizados a
1 mg/mL contra nauplios de A. Salina.
24
Cuadro 1. Tamizaje de actividad Citotóxica Contra Nauplios de A. salina.
Como el porcentaje de mortalidad de nauplios de A. salina en todos los compuestos fue del 100 por ciento
(CL50 menor de 1 mg/ml), se realizó la prueba nuevamente utilizando concentraciones mucho más bajas.
Fuente: Datos experimentales.
III.1.8.2 Determinación de la CL50 de Cembranoides 2,11-ciclizados.
La CL50, se calculó por el método de Trimmed Spearman-Karber v. 1.5 (Hamilton
et. al. 1977), utilizando tres diferentes concentraciones de los compuestos a evaluar (1.0,
0.5 y 0.25 g/ml), seleccionadas debido a que la literatura reporta concentraciones de
citotoxicidad para asbestininos en el rango de los 10 g/mL (Cóbar, O.M. 1996).
Cuadro 2. Concentración Letal Media de Cembranoides 2,11-ciclizados
Compuesto % de nauplios muertos
por cada concentración
CL50
g/mL
(nanomolar)
Intervalo de
Confianza
LCS-LCI al 95% 1.0 g/mL 0.50 g/mL 0.01 g/ml
4-deoxyasbestinino G 100 91 6 0.60
(1480)
0.30-0.90
6-ester urocánico de
4-deoxyasbestinino G
100 100 22 0.14
(260)
0.08-0.30
Briarellina E 100 98 9 0.40
(830)
0.10-0.70
6-ester urocánico de
Briarellina E
100 100 87 0.09
(150)
0.06-0.12
Asbestinino 20 100 98 8 0.50
(1320)
0.20-0.80
6-ester urocánico de
Asbestinino 20
100 100 24 0.12
(230)
0.09-0.16
Asbestinino 7 100 100 83 0.10
(200)
0.07-0.15
6-ester urocánico de
Asbestinino 7
100 100 92 0.07
(110)
0.04-0.10
6-glucósido de
Asbestinino 7
10 0 0 10.0
(14950)
7.0-13.0
Fuente: Datos experimentales.
Compuesto Pozo
No.1
Muertos
/Total
Pozo
No.2
Muertos
/Total
Pozo
No.3
Muertos
/Total
Pozo
No.4
Muertos
/Total
Pozo
No.5
Muertos
/Total
Total
muertos/
Total
ensayo
Nauplios
muertos
(%)
4-deoxyasbestinino G 10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
6-ester urocánico de
4-deoxyasbestinino G
10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
Briarellina E 10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
6-ester urocánico de
Briarellina E
10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
Asbestinino 20 10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
6-ester urocánico de
Asbestinino 20
10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
Asbestinino 7 10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
6-ester urocánico de
Asbestinino 7
10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
6-glucósido de
Asbestinino 7
10/10 10/10 10/10 10/10 10/10 50/50 100
25
III.1.9 Modelaje Molecular y Propiedades Farmacofóricas de Cembranoides 2,11-
ciclizados Derivatizados.
Los resultados obtenidos de los cembranoides 2,11-ciclizados naturales (se incluyen
Sarcodictina A y B y Eleutherobina) y derivatizados se presentan en las tablas siguientes:
III.1.9.1 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de 4-
deoxyasbestinino G.
Cuadro 3. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de 4-deoxyasbestinino G.
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
O
OH
O
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C24H38O5
Peso molecular (umas) 406.58
Calor de Formación (Kcal/Mol) -224.7174837
cLogP 3.960
TPSA 64.990
No. de Aceptores 5
No. de Donadores 1
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 68/71
Anillos 4
Enlaces Rotables 9
Atomos Aromáticos 0
Momento Dipolar (Debyes) 5.17
Fuente: Datos experimentales
III.1.9.2 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de 6-ester
urocánico de 4-deoxyasbestinino G.
Cuadro 4. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de 6-éster urocánico de 4-
deoxyasbestinino G.
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
NH
N
O
26
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C31H44N2O6
Peso molecular (umas) 508.70
Calor de Formación (Kcal/Mol) -181.2676869
cLogP 4.958
TPSA 101.770
No. De Aceptores 7
No. De Donadores 0
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 83/88
Anillos 5
Enlaces Rotables 13
Atomos Aromáticos 5
Momento Dipolar (Debyes) 5.94
Fuente: Datos experimentales.
III.1.9.3 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de Briarellina E.
Cuadro 5. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de Briarellina E.
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
OH
H3COH
O
O Propiedad Valor
Fórmula Molecular C28H48O6
Peso molecular (umas) 480.69
Calor de Formación (Kcal/Mol) -298.172237
cLogP 4.635
TPSA 85.220
No. de Aceptores 6
No. de Donadores 2
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 82/85
Anillos 4
Enlaces Rotables 15
Atomos Aromáticos 0
Momento Dipolar (Debyes) 7.95
Fuente: Datos experimentales
III.1.9.4 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de 6-ester
urocánico de Briarellina E.
Cuadro 6. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de 6-ester urocánico de
Briarellina E.
27
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
O
H3COH
O
O
NHN
O
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C35H54O7N2
Peso molecular (umas) 614.82
Calor de Formación (Kcal/Mol) -249.7295243
cLogP 5.633
TPSA 122.000
No. de Aceptores 8
No. de Donadores 1
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 98/102
Anillos 5
Enlaces Rotables 19
Atomos Aromáticos 5
Momento Dipolar (Debyes) 12.01
Fuente: Datos experimentales.
III.1.9.5 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de Asbestinino 20.
Cuadro 7. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de Asbestinino 20.
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
OH
O
O
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C22H34O5
Peso molecular (umas) 378.52
Calor de Formación (Kcal/Mol) -217.1479208
cLogP 3.180
TPSA 64.990
No. de Aceptores 5
No. de Donadores 1
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 61/65
Anillos 4
Enlaces Rotables 7
Atomos Aromáticos 0
Momento Dipolar (Debyes) 4.50
Fuente: Datos experimentales.
28
III.1.9.6 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de 6-ester
urocánico de Asbestinino 20.
Cuadro 8. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de 6-ester urocánico de
Asbestinino 20.
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
O
NHN
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C29H40N2O6
Peso molecular (umas) 512.66
Calor de Formación (Kcal/Mol) -175.0312442
cLogP 4.178
TPSA 101.770
No. de Aceptores 7
No. de Donadores 0
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 77/82
Anillos 5
Enlaces Rotables 11
Atomos Aromáticos 5
Momento Dipolar (Debyes) 7.26
Fuente: Datos experimentales.
III.1.9.7 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de Asbestinino 7.
Cuadro 9. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de Asbestinino 7.
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
OH
O
O
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C29H48O7
Peso molecular (umas) 508.70
Calor de Formación (Kcal/Mol) -345.6624569
cLogP 4.672
TPSA 91.290
No. de Aceptores 7
No. de Donadores 1
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
29
Atomos/Enlaces 84/87
Anillos 4
Enlaces Rotables 16
Atomos Aromáticos 0
Momento Dipolar (Debyes) 3.40
Fuente: Datos experimentales.
III.1.9.8 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de 6-ester
urocánico de Asbestinino 7.
Cuadro 10. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de 6-ester urocánico de
Asbestinino 7.
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
O
NH
N
O
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C36H52O8
Peso molecular (umas) 640.83
Calor de Formación (Kcal/Mol) -301.9882719
cLogP 5.670
TPSA 128.070
No. de Aceptores 9
No. de Donadores 0
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 98/103
Anillos 5
Enlaces Rotables 19
Atomos Aromáticos 5
Momento Dipolar (Debyes) 5.44
Fuente: Datos experimentales.
III.1.9.9 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de 6-glucósido de
Asbestinino 7.
Cuadro 11. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de 6-glucósido de
Asbestinino 7.
O
O
CH2
H3C OCH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
O
O OH
H
HOH
H
HHO
H
OH
30
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C35H56O12
Peso molecular (umas) 668.84
Calor de Formación (Kcal/Mol) -579.9620745
cLogP 2.210
TPSA 170.440
No. de Aceptores 12
No. de Donadores 4
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 103/108
Anillos 5
Enlaces Rotables 21
Atomos Aromáticos 0
Momento Dipolar (Debyes) 4.66
Fuente: Datos experimentales.
III.1.9.10 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de Asbestinino 9
Cuadro 12. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de Asbestinino 9.
O
O
CH2
H3C CH3
H
HH
H
H
H3C
O
O
O
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C24H38O5
Peso molecular (umas) 404.56
Calor de Formación (Kcal/Mol) - 217.8402815
cLogP 4.168
TPSA 61.830
No. de Aceptores 5
No. de Donadores 0
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 65/70
Anillos 4
Enlaces Rotables 8
Atomos Aromáticos 0
Momento Dipolar (Debyes) 5.98
Fuente: Datos experimentales.
III.1.9.11 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de Sarcodictina A.
31
Cuadro 13. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de Sarcodictina A.
O
CH3
CH3 CH3
CH3
OHCOOMe
O
O
N
N
CH3
Sarcodictina A Propiedad Valor
Fórmula Molecular C28H36N2O6
Peso molecular (umas) 496.60
Calor de Formación (Kcal/Mol) -147.9499519
cLogP 3.834
TPSA 112.770
No. de Aceptores 7
No. de Donadores 1
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 76/80
Anillos 4
Enlaces Rotables 13
Atomos Aromáticos 5
Momento Dipolar (Debyes) 7.95
Fuente: Datos experimentales.
III.1.9.12 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de Sarcodictina B.
Cuadro 14. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas Sarcodictina B.
H
H
H3C CH3
O
CH3
OH
O
O
N
N
CH3
COOEt
H3C
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C29H38N2O6
Peso molecular (umas) 510.63
Calor de Formación (Kcal/Mol) -153.7614918
cLogP 4.224
TPSA 112.770
No. de Aceptores 7
No. de Donadores 1
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 79/83
Anillos 4
Enlaces Rotables 14
Atomos Aromáticos 5
Momento Dipolar (Debyes) 7.79
Fuente: Datos experimentales.
32
III.1.9.13 Optimización Geométrica y Propiedades Farmacofóricas de Eleutherobina.
Cuadro 15. Propiedades Fisicoquímicas y Farmacofóricas de Eleutherobina.
H
HH3C
H3C CH3
O
CH3
OH
O
O
N
N
CH3
O
HO
H
H
OH
H
O
OH
O
Propiedad Valor
Fórmula Molecular C34H46N2O9
Peso molecular (umas) 642.74
Calor de Formación (Kcal/Mol) -331.9393618
cLogP 3.055
TPSA 160.690
No. de Aceptores 11
No. de Donadores 2
Negativos Ionizables 0
Positivos Ionizables 0
Atomos/Enlaces 99/104
Anillos 5
Enlaces Rotables 19
Atomos Aromáticos 5
Momento Dipolar (Debyes) 6.24
Fuente: Datos experimentales.
33
III.2 Discusión de Resultados
III.2.1 Obtención de la Muestra y Extractos Orgánicos.
El espécimen a trabajar fue colectado y tratado preliminarmente como lo establece
la literatura relacionada con Química de Productos Naturales Marinos y publicaciones
específicas sobre cembranoides 2,11-ciclizados.
Los procedimientos de obtención del extracto orgánico crudo se orientaron a
separar las fracciones no polares, las que se fraccionaron posteriormente utilizando
Cromatografía de Exclusión de Tamaño para separar los cembranoides de peso molecular
intermedio de otras moléculas orgánicas y clorofila.
Los protocolos de fraccionamiento del extracto crudo y obtención de los extractos
orgánicos se orientaron hacia la separación por polaridad de los distintos tipos de
metabolitos secundarios, trabajándose el extracto n-hexánico por ser el más rico en
cembranoides 2,11-ciclizados de acuerdo a la literatura y estudios realizados de
Cromatografía en Capa Fina.
El rendimiento del extracto crudo fue superior (12% vs. 9%) de lo reportado para
este organismo, debiéndose principalmente al cuidado en los procedimientos de
extracción y fraccionamiento, así como la experiencia previa del investigador principal en
el aislamiento y separación de estos metabolitos.
El rendimiento de los extractos orgánicos es ligeramente diferente a los reportados
en la literatura, ya que se buscó enriquecer el extracto n-hexánico realizando más
extracciones exhaustivas con dicho solvente, lo que produjo un 74 % de rendimiento, en
lugar del típico cercano al 50%.
Lo anterior en detrimento del extracto clorofórmico, del que se obtuvo un 14% de
rendimiento en lugar del 30% aproximadamente que se reporta en la literatura.
III.2.2 Síntesis, Aislamiento y Elucidación Estructural de Cembranoides 2,11-
ciclizados.
III.2.2.1 Aislamiento y Elucidación Estructural de Asbestinino 9.
El aislamiento de Asbestinino 9 se realiza de acuerdo a lo reportado en la
literatura, utilizando HPLC fase reversa con columna analítica ODS como fase
estacionaria y MeOH/H2O como fase móvil.
Sin embargo debido a la solubilidad de la muestra, se utilizó una proporción de
fase móvil de 9:1 en lugar de 7:3, dando buenos resultados (40% de rendimiento del
compuesto puro con relación a la fracción purificada).
El compuesto se identifica fácilmente por sus señales de 1H-RMN y
13C-RMN
producidas por su doble enlace exocíclico, el éster butirato, la ausencia de señales
debidas a H6 y el aparecimiento del grupo carbonilo a 206 ppm y las típicas del esqueleto
de los asbestininos.
El espectro de masas de impacto electrónico del compuesto muestra al ion
molecular a m/z 404 y el fragmento a m/z 316 (pérdida del grupo butirato), que confirman
su identidad.
34
Este compuesto por no poseer un grupo hidroxilo en posición 6 (carbonilo en su
lugar), no se utilizó para derivatización, sin embargo se utilizará para confirmar su
estructura y determinar si el grupo carbonilo se encuentra en la posición 4 o 6.
III.2.2.2 Aislamiento y Elucidación Estructural de 4-Deoxyasbestinino G.
El aislamiento de 4-Deoxyasbestinino G se realiza de acuerdo a lo reportado en la
literatura, utilizando Cromatografía en Columna (CC) en fase normal, con Sílica Gel G60
como fase estacionaria y n-hexano/EtOAc (8:2) como fase móvil.
Sin embargo, debido a la solubilidad de la muestra, se utilizó únicamente una
columna de fase estacionaria, en lugar de el “tándem” 2% de MeOH en CHCl3 seguido de
n-hexano/EtOAc (85:15) que reporta la literatura.
Se obtuvo un rendimiento aceptable del 16% del compuesto puro con relación a la
fracción purificada.
El compuesto se identifica inequivocamente por sus señales de 1H-RMN y
13C-
RMN producidas por su doble enlace exocíclico, el éster butirato, la presencia de señales
debidas a H6 y C6 en la zona de 4 ppm y 90 ppm respectivamente y las típicas del
esqueleto de los asbestininos.
El espectro de masas de impacto electrónico del compuesto muestra al ion
molecular a m/z 406, el fragmento a m/z 318 (pérdida del grupo butirato) y el fragmento
debido a la pérdida consecutiva de butirato y agua desde el ion molecular a m/z 300, que
confirman su identidad.
Parte de este compuesto será derivatizado a su éster urocánico y otra para
confirmar si posee un grupo hidroxilo o peroxilo en posición 6 de acuerdo a la hipótesis
planteada por Rodríguez y colaboradores (Rodríguez, 2006).
III.2.2.3 Síntesis, Aislamiento y Elucidación Estructural de 6-ester urocánico de 4-
Deoxyasbestinino G.
La síntesis del 6-ester urocánico de 4-Deoxyasbestinino G se realiza de acuerdo al
protocolo reportado en la literatura, el rendimiento de la esterificación es satisfactorio
(62.5% contra un 76 % reportado para urocanización de compuestos de estructura
similar).
El aislamiento del compuesto se logra al rotaevaporar el solvente remanente y
extraer en fase etérea al compuesto orgánico de acuerdo al protocolo reportado en la
literatura.
La identificación del compuesto se logra inequívocamente por sus señales de 1H-
RMN a 6.0, 7.1, 7.3 y 7.6, típicos de que el grupo urocanato se enlazó a la molécula.
El hecho de que H6 del compuesto derivatizado se desplazó 0.96 ppm a campo
bajo con relación a 4-Deoxyasbestinino G, es indicativo de que existió esterificación en
esta posición.
Su espectro de masas de impacto electrónico muestra al ion molecular a m/z 526,
el fragmento a m/z 438 (pérdida del grupo butirato), m/z 388 (pérdida del grupo
urocanato) y m/z 300 (pérdida de los grupos butirato y urocanato) a partir del ion
molecular.
35
No se tomó el punto de fusión del compuesto debido al riesgo de su
descomposición y pérdida irreversible.
III.2.2.4 Aislamiento y Elucidación Estructural de Briarellina E.
El aislamiento de Briarellina E se realiza de acuerdo a lo reportado en la literatura,
utilizando HPLC fase reversa con columna analítica ODS como fase estacionaria y
MeOH/H2O (8:2) como fase móvil.
Se obtuvo un muy buen rendimiento del 52% del compuesto puro con relación a
la fracción purificada.
El compuesto se identifica fácilmente por sus señales de 1H-RMN y
13C-RMN
producidas por su doble enlace exocíclico, el éster octanoato, la presencia de señales
debidas a H6 y C6 en la zona de 4 ppm y 74 ppm respectivamente y las típicas del
esqueleto de las briarellinas.
Es importante señalar la presencia de las señales de 1H-RMN a 3.4 y 3.6 ppm y de
13C-RMN a 67 ppm, que indican que no posee el grupo lactónico típico de otras
briarellinas.
El espectro de masas de impacto electrónico del compuesto muestra al ion
molecular a m/z 478, el fragmento a m/z 334 (pérdida del grupo octanoato) y el fragmento
a m/z 316 debido a la pérdida sucesiva de octanoato y agua, que confirman su identidad.
Parte de este compuesto será derivatizado a su éster urocánico.
III.2.2.5 Síntesis, Aislamiento y Elucidación Estructural de 6-ester urocánico de
Briarellina E.
La síntesis del 6-ester urocánico de Briarellina E se realiza de acuerdo al
protocolo reportado en la literatura, el rendimiento de la esterificación es satisfactorio
(61% contra un 76 % reportado para urocanización de compuestos de estructura similar).
El aislamiento del compuesto se logra al rotaevaporar el solvente remanente y
extraer en fase etérea al compuesto orgánico de acuerdo al protocolo reportado en la
literatura.
La identificación del compuesto se logra inequívocamente por sus señales de 1H-
RMN a 6.2, 7.2, 7.4 y 7.8, típicos de que el grupo urocanato se enlazó a la molécula.
El hecho de que H6 del compuesto derivatizado se desplazó 1.06 ppm a campo
bajo con relación a Briarellina E, es indicativo de que existió esterificación en esta
posición.
Su espectro de masas de impacto electrónico muestra al ion molecular a m/z 598,
el fragmento a m/z 454 (pérdida del grupo octanoato), m/z 460 (pérdida del grupo
urocanato) y m/z 316 (pérdida de los grupos octanoato y urocanato) a partir del ion
molecular.
No se tomó el punto de fusión del compuesto debido al riesgo de su
descomposición y pérdida irreversible.
III.2.2.6 Aislamiento y Elucidación Estructural de Asbestinino 20.
El aislamiento de Asbestinino 20 se realiza de acuerdo a lo reportado en la
literatura, inicialmente HPLC en fase reversa (columna ODS y MeOH:H2O 75:25),
36
seguido de Cromatografía en Columna (CC) en fase normal, con Sílica Gel G60 como
fase estacionaria y n-hexano/EtOAc (8:2) como fase móvil.
Se obtuvo un rendimiento bueno del 52% del compuesto puro con relación a la
fracción purificada.
El compuesto se identifica inequivocamente por sus señales de 1H-RMN y
13C-
RMN producidas por su doble enlace exocíclico, el éster acetato, la presencia de señales
debidas a H6 y C6 en la zona de 4 ppm y 75 ppm respectivamente y las típicas del
esqueleto de los asbestininos.
El espectro de masas de impacto electrónico del compuesto muestra al ion
molecular a m/z 378, el fragmento a m/z 318 (pérdida del grupo acetato) y el fragmento
debido a la pérdida de agua desde el ion molecular a m/z 360, que confirman su identidad.
Parte de este compuesto será derivatizado a su éster urocánico.
III.2.2.7 Síntesis, Aislamiento y Elucidación Estructural de. 6-ester urocánico de
Asbestinino 20.
La síntesis del 6-ester urocánico de Asbestinino 20 se realiza de acuerdo al
protocolo reportado en la literatura, el rendimiento de la esterificación es satisfactorio
(52% contra un 76 % reportado para urocanización de compuestos de estructura similar).
El aislamiento del compuesto se logra al rotaevaporar el solvente remanente y
extraer en fase etérea al compuesto orgánico de acuerdo al protocolo reportado en la
literatura.
La identificación del compuesto se logra inequívocamente por sus señales de 1H-
RMN a 6.1, 7.1, 7.5 y 7.8, típicos de que el grupo urocanato se enlazó a la molécula.
El hecho de que H6 del compuesto derivatizado se desplazó 1.05 ppm a campo
bajo con relación a Asbestinino 20, es indicativo de que existió esterificación en esta
posición.
Su espectro de masas de impacto electrónico muestra al ion molecular a m/z 498,
el fragmento a m/z 438 (pérdida del grupo acetato), m/z 360 (pérdida del grupo
urocanato) y m/z 300 (pérdida de los grupos acetato y urocanato) a partir del ion
molecular.
No se tomó el punto de fusión del compuesto debido al riesgo de su
descomposición y pérdida irreversible.
III.2.2.8 Aislamiento y Elucidación Estructural de Asbestinino 7.
El aislamiento de Asbestinino 7 se realiza de acuerdo a lo reportado en la literatura,
utilizando HPLC en fase reversa (columna ODS como fase estacionaria y MeOH:H2O
93:07 como fase móvil).
Se obtuvo un buen rendimiento del 48% del compuesto puro con relación a la
fracción purificada.
El compuesto se identifica inequivocamente por sus señales de 1H-RMN y
13C-
RMN producidas por su doble enlace exocíclico, el éster acetato, el éster octanoato, la
presencia de señales debidas a H6 y C6 en la zona de 4.5 ppm y 87 ppm respectivamente
y las típicas del esqueleto de los asbestininos.
El espectro de masas de impacto electrónico del compuesto muestra al ion
molecular a m/z 520, los fragmentos a m/z 460 (pérdida del grupo acetato), m/z 376
37
(pérdida del grupo octanoato y el fragmento debido a la pérdida de agua desde el ion
molecular a m/z 502, que confirman su identidad.
Parte de este compuesto será derivatizado a su éster urocánico y su glucósido.
III.2.2.9 Síntesis, Aislamiento y Elucidación Estructural de 6-ester urocánico de
Asbestinino 7.
La síntesis del 6-ester urocánico de Asbestinino 7 se realiza de acuerdo al protocolo
reportado en la literatura, el rendimiento de la esterificación es excelente (72% contra un
76 % reportado para urocanización de compuestos de estructura similar).
El aislamiento del compuesto se logra al rotaevaporar el solvente remanente y
extraer en fase etérea al compuesto orgánico de acuerdo al protocolo reportado en la
literatura.
La identificación del compuesto se logra inequívocamente por sus señales de 1H-
RMN a 6.0, 7.1, 7.3 y 7.6, típicos de que el grupo urocanato se enlazó a la molécula.
El hecho de que H6 del compuesto derivatizado se desplazó 0.66 ppm a campo
bajo con relación a Asbestinino 7, es indicativo de que existió esterificación en esta
posición.
Su espectro de masas de impacto electrónico muestra al ion molecular a m/z 640,
el fragmento a m/z 580 (pérdida del grupo acetato), m/z 502 (pérdida del grupo
urocanato) y m/z 496 (pérdida del grupo octanoato) a partir del ion molecular.
No se tomó el punto de fusión del compuesto debido al riesgo de su
descomposición y pérdida irreversible.
III.2.2.10 Síntesis, Aislamiento y Elucidación Estructural de 6-glucósido de
Asbestinino 7.
La síntesis del 6-ester urocánico de Asbestinino 7 se realiza de acuerdo al
protocolo reportado en la literatura en dos etapas; primero la benzoilación de asbestinino
7 y luego la glucosidación del asbestinino benzoilado.
III.2.2.10.1 Benzoilación de Asbestinino 7.
El aislamiento del compuesto se logra al rotaevaporar el solvente remanente y
extraer en éter dietílico al compuesto orgánico de acuerdo al protocolo reportado en la
literatura, obteniéndose un buen 70% de rendimiento de reacción.
La identificación del compuesto se logra inequívocamente por sus señales de 1H-
RMN a 6.9, 7.1, 7.3 y dos a 7.4 ppm, correspondientes al anillo bencénico del grupo
benzoato, indicativo de que este grupo se enlazó a la molécula.
El hecho de que H6 del compuesto derivatizado se desplazó 0.86 ppm a campo
bajo con relación a Asbestinino 7, es indicativo de que existió esterificación en esta
posición.
Su espectro de masas de impacto electrónico muestra al ion molecular a m/z 624,
el fragmento a m/z 564 (pérdida del grupo acetato), m/z 502 (pérdida del grupo benzoato)
y m/z 480 (pérdida del grupo octanoato) a partir del ion molecular.
38
Al tomarse el punto de fusión del compuesto puro, la muestra se descompuso
alrededor de los 398 grados centígrados, por lo que se tomó la determinación de no
obtener el punto de fusión de los demás derivados, al sintetizarse poca cantidad de
muestra y evitar así su pérdida irreversible.
III.2.2.10.2 Glucosidación de Asbestinino 7-6-benzoilado.
El producto de la reacción de glucosidación se purifica al extraerse con acetato de
etilo y rotaevaporarse el exceso del solvente de acuerdo al protocolo establecido en la
literatura.
El rendimiento de la reacción (17%) puede considerarse bueno, tomando en
cuenta que la reacción es multietapas y compleja para realizarse.
La identificación de la molécula se logra por sus señales de 1H-RMN adicionales
al de Asbstinino 7 a 3.35, 3.40, 4.47, 3.50, 3.54 y 3.62 ppm, que corresponden a los
protones hidroxilados de la glucosa. Adicionalmente el protón anomérico de la glucosa se
identifica por su señal de 1H-NMR a 4.6 ppm.
El desplazamiento a campo bajo de la señal asignada a H6 en Asbestinino 7, por
1.3 ppm es indicativo de existió glucosidación en esta posición.
Los fragmentos a m/z de 682 (ion molecular), m/z 622 (pérdida del grupo acetato),
m/z 538 (pérdida del grupo octanoato) y m/z 502 (pérdida de glucosa), confirman la
identidad del compuesto.
Al intentar tomar el punto de fusión de este derivado, este se descompuso arriba
de los 225 oC.
III.2.3 Actividad Citotóxica de Cembranoides 2,11-ciclizados.
III.2.3.1 Tamizaje inicial.
El resultado del tamizaje inicial de la actividad citotóxica contra nauplios de A.
salina, de los cuatro cembranoides 2,11-ciclizados naturales aislados, los cuatro
derivados 6-ester urocánico y el derivado 6-glucosidado, resultó en la muerte del 100 %
de los nauplios en cada ensayo a una concentración de 1 mg/mL del compuesto.
Este resultado esperado, debido a la citotoxicidad reportada en la literatura para
los cembranoides 2,11-ciclizados, originó que se bajara la concentración de los
compuestos a un rango entre 1 g/mL y 0.01 g/mL.
III.2.3.2 Tamizaje a concentraciones de entre 1 g/mL y 0.01 g/mL y determinación de
la CL50.
Al analizar los resultados de CL50 de los cembranoides 2,11-ciclizados naturales,
se observa que todos ellos tienen valores en el rango nanomolar, siendo el de menor valor
Asbestinino 7 (200 nM), luego Briarellina E (830 nM), Asbestinino 20 (1320 nM) y 4-
deoxyasbestinino G (1480 nM).
Estos valores son importantes, ya que demuestran se altamente citotóxicos y
comparables a Eleutherobina (200 nM).
39
Realizando un análisis de la relación Estructura/CL50 de los cembranoides
naturales, se puede asumir que la presencia del ester octanoato (común en Briarellina E y
Asbestinino 7) puede ser factor que determine el incremento en su citotoxicidad ante los
nauplios de A. salina.
Comparando entre sí los datos de CL50 de los cembranoides 6-ester urocánico, se
observa la misma tendencia en el orden de citotoxicidad que la observada en los
cembranoides naturales, sin embargo es importante señalar que se incrementa la
citotoxicidad entre un 15% a un 18%, siendo congruente con la hipótesis planteada de
que al urocanizar estos cembranoides en la posición 6 se incrementaría su citotoxicidad.
Al analizar las concentraciones letales medias a nivel nanomolar, se observa que
el 6-ester urocánico de Asbestinino 7 (110 nM) y el de Briarellina E (150 nM) posen
valores de CL50 inferiores a Eleutherobina (200 nM), lo que los hace muy promisorios
como probables medicamentos anticáncer, bajo el supuesto de que este último se
encuentra en Fase Clínica III en el Instituto Nacional del Cáncer en Estados Unidos -
NCI- como medicamento contra cierto tipo de cáncer.
Los otros derivados 6-éster urocánico, presentaron valores cercanos a
Eleutherobina pero superiores a ella (230 nM para Asbestinino 20 y 260 nM para 4-
deoxyasbestinino G).
Lo anterior no los descarta como potenciales medicamentos anticáncer.
Es importante observar que la similitud estructural existente entre Asbestinino 20 y 4-
deoxyasbestinino G y sus derivados 6-ester urocánico entre sí, genera citotoxicidades
similares entre sí (230 nM vs. 260 nM respectivamente).
La CL50 mostrada por el 6-Glucósido de Asbestinino 7 fue baja (14,950 nM o
14.95 M) fue pobre, lo que determinó que por la complejidad de la reacción multietapas
de síntesis, el bajo rendimiento observado en la misma y la baja cantidad de
cembranoides naturales aislados, no se sintetizaran los otros tres derivados 6-
glucosidados.
Es de hacer notar que los valores de CL50 reportados en la literatura para algunos
cembranoides 2,11-ciclizados se encuentra en el rango de 200 a 1,000 nM, con
Asbestinino 7 presentando 288 nM (Leukemia/CCRF-CEM), sin embargo fueron
calculados utilizando líneas celulares cancerosas como Breast Cancer/MCF7,
Leukemia/CCRF-CEM y Colon Cancer/HCT-116 entre otras, por que las comparaciones
con los valores de CL50 obtenidos contra nauplios de A. salina no pueden hacerse
directamente.
III.2.4 Modelaje Molecular y Propiedades Farmacofóricas de Cembranoides 2,11-
ciclizados.
III.2.4.1 Conformación de Mínima Energía.
Al comparar los parámetros fisicoquímicos obtenidos en la Optimización Geométrica,
entendiéndola como la técnica fundamental de la modelización molecular, cuyo objetivo
es obtener las conformaciones de baja energía de los compuestos estudiados, se infiere
que:
40
Dentro de los cembranoides 2,11-ciclizados naturales, la conformación de mínima
energía más alta corresponde a Asbestinino 7 (-345.6624569 Kcal/mol) y la más
baja a Asbestinino 20 (-217.1479208 Kcal/mol).
Dentro de los derivados éster urocánico corresponde el de valor más alto de
conformación de mínima energía al derivado de Asbestinino 7 (-301.9882719
Kcal/mol) y el de más baja al derivado de Asbestinino 20 (-175.0312442
Kcal/mol).
Lo anterior es congruente con que a un incremento en el peso molecular del
compuesto, su valor de mínima energía conformacional es más alto.
Comparando los valores de mínima energía conformacional del derivado éster
urocánico de 4-deoxyasbestinino G (pm 508 umas, -181.2676869 Kcal/mol) con los de
Sarcodictina B (pm 510 umas, -153.7614918 Kcal-mol), que poseen peso molecular
comparable, se observa un menor valor en Sarcodictina B, indicando que es una molécula
energéticamente más estable.
Los valores de Momento Dipolar son distintos para ambos compuestos (7.75 D para
Sarcodictina B y 5.49 D para éster urocánico de 4-deoxyasbestinino G), lo que indica que
es una molécula más polar Sarcodictina B, debido fundamentalmente a la posición del
éster urocánico en la molécula.
Los valores de Mínima Energía Conformacional como de Momento Dipolar de
ambos compuestos comparados, indican que Sarcodictina B pudiera acomodarse mejor
en el complejo que forman con las tubulinas (su mecanismo de acción) que lo que
pudiera hacer el éster urocánico de 4-deoxyasbestinino B.
III.2.4.2 Propiedades Farmacofóricas.
III.2.4.2.1 Topological Molecular Polar Surface Area (TPSA).
Este parámetro calcula la suma de las contribuciones superficiales de los
fragmentos polares de una molécula y permite predecir las propiedades de transporte de
la molécula a través de la membrana celular, con menores valores de TPSA para un mejor
transporte a través de la membrana celular.
Comparando los valores de los cembranoides 2,11-ciclizados naturales, se infiere
que el orden de mejor transporte a través de la membrana celular es Asbestinino 9 (61.83
A2), Asbestinino 20 y 4-deoxyasbstinino G (64.99 A
2), Briarellina E (85.22 A
2) y por
último Asbestinino 7 (95.29 A2), lo anterior debido a que a mayor tamaño de la molécula
es un poco más difícil su transporte, no obstante que Asbestinino 7 y Briarellina E poseen
mayor cantidad de grupos apolares (de mayor capacidad de transporte a través de
membranas celulares).
Al comparar los valores de TPSA de Sarcodictina B (112.770 A2) con el éster
urocánico de 4-deoxyasbestinino G (101.770 A2) y Eleutherobina (160.690 A
2), se
predice un mejor transporte del derivado éster urocánico incluso mejor que la molécula
siendo estudiada en Fase Clínica III en el FDA como medicamento anticáncer.
41
III.2.4.2.2 Relación de Solubilidad n-octanol/agua (cLogP).
Este valor (el logaritmo del coeficiente de partición n-octanol/agua) permite
determinar la hidrofilicidad del compuesto. Valores altos de cLogP significa bajas
hidrofilicidades y pobre absorción y permeación en membranas celulares. Generalmente
buenos valores se establecen debajo de 5.0
Los valores para los cembranoides 2,11-ciclizados naturales aislados se
encuentran entre 4.672 y 3.180, todos valores dentro del rango aceptable, con el mejor en
Asbestinino 20.
Los derivados éster urocánico sintetizados, muestran valores mas altos que sus
moléculas predecesoras, con valores entre 5.670 y 4.178, con los derivados de Briarellina
E (5.633) y Asbestinino 7 (5.670) arriba de 5.0.
Los valores de cLogP de lo derivados éster urocánicos de Asbestinino 20 (4.178)
y 4-deoxyasbestinino G (4.958) son aceptables y menores de 5.0.
Al comparar el cLogP del éster urocánico de 4-deoxyasbestinino G (4.958) y
Asbestinino 20 (4.178) con los de Sarcodictina B (4.224) y Eleutherobina (3.055), se
observa que todos están por debajo de 5.0 con un buen potencial para los derivados
urocánicos sintetizados en esta investigación.
Los otros parámetros farmacofóricos calculados (Número de Aceptores, Número
de Donadores, Grupos Negativos Ionizables, Grupos Positivos Ionizables, Relación
Átomos/Enlaces, Número de Átomos Aromáticos, Número de Anillos y Enlaces
Rotables) son comparables a los compuestos que estudia el FDA como medicamentos
anticáncer y se utilizan como insumos para el cálculo de TPSA y cLogP.
42
PARTE IV.
IV.1 CONCLUSIONES
1. Se sintetizó un derivado 6-glucósido de cembanoide 2,11-ciclizado (6-glucósido
de Asbestinino 7).
2. Se sintetizaron cuatro derivados 6-éster urocánico de cembranoides 2,11-
ciclizados (6-éster urocánicos de Asbestinino 7, Asbestinino 20, 4-
deoxyasbestinino G y Briarellina E).
3. Se determinó la actividad citotóxica contra nauplios de Artemia salina de los
cinco cembranoides 2,11-ciclizados sintetizados.
4. Los cuatro cembranoides 2,11-ciclizados ester-urocánico sintetizados, poseen
valores de CL50 a nivel nanomolar contra nauplios de Artemia salina,
comparables a Eleutherobina.
5. El cembranoide 2,11-ciclizado 6-glucósido sintetizado, posee un valor de CL50 a
nivel micromolar contra nauplios de Artemia salina, no comparable a
Eleutherobina, los cembranoides naturales y derivados 6-ester urocánicos
sintetizados.
6. Se aislaron cinco cembranoides 2,11-ciclizados de Briareum asbestinum, cuatro
con un grupo hidroxilo sobre C6 de la molécula (Asbestinino 7, Asbestinino 20,
4-deoxyasbestinino G y Briarellina E) y uno con grupo carbonilo en dicha
posición (Asbestinino 9).
7. Se determinó la actividad citotóxica contra nauplios de Artemia salina de cuatro
cembranoides 2,11-ciclizados naturales aislados.
8. Los cuatro cembranoides 2,11-ciclizados naturales aislados, poseen valores de
CL50 a nivel nanomolar contra nauplios de Artemia salina, comparables a
Eleutherobina.
9. Se calculó y graficó la conformación de mínima energía de la molécula de trece
cembranoides 2,11-ciclizados; 5 cembranoides 2,11-ciclizados naturales
(Asbestininos 7, 9, 20, 4-deoxyasbestinino G y Briarellina E), cuatro
cembranoides 2,11-ciclizados 6-éster urocánico (derivados de Asbestininos 7, 20,
4-deoxyasbestinino G y Briarellina E), un derivado de cembranoide 2,11-
ciclizado 6-glucósido (Asbestinino 7) y tres cembranoides 2,11-ciclizados tipo
sarcodictina (Sarcodictinas A y B y Eleutherobina) para utilizar como modelos de
comparación.
10. Se calculó y graficó las propiedades farmacofóricas (TPSA, cLogP, Número de
Aceptores, Número de Donadores, Grupos Negativos Ionizables, Grupos
Positivos Ionizables, Relación Átomos/Enlaces, Número de Átomos Aromáticos,
Número de Anillos y Enlaces Rotables) de la molécula de trece cembranoides
2,11-ciclizados; 5 cembranoides 2,11-ciclizados naturales (Asbestininos 7, 9, 20,
4-deoxyasbestinino G y Briarellina E), cuatro cembranoides 2,11-ciclizados 6-
éster urocánico (derivados de Asbestininos 7, 20, 4-deoxyasbestinino G y
Briarellina E), un derivado de cembranoide 2,11-ciclizado 6-glucósido
(Asbestinino 7) y tres cembranoides 2,11-ciclizados tipo sarcodictina
(Sarcodictinas A y B y Eleutherobina) para utilizar como modelos de
comparación.
43
11. Se realizó extensa revisión bibliográfica sobre lo reportado en cembranoides 2,11-
ciclizados, originándose una publicación en la revista Natural Product Research
de Taylor & Francis Cóbar, O. Survey of 2,11-cyclized cembranoids from
Caribbean sources. Natural Product Research. 2009, 23 (1), 26-43.
44
IV.2 RECOMENDACIONES
1. Sintetizar nuevos Cembranoides 2,11-ciclizados 6-derivados, para optimizar la
ruta sintética.
2. Aislar nuevamente cembranoides 2,11-ciclizados de Briareum asbestinum, para
continuar con estudios de síntesis orgánica y actividad biológica.
3. Realizar pruebas de actividad citotóxica sobre líneas celulares cancerosas para
tener datos de su CL50 más exactos y comparables con los que se estudian en el
FDA de los Estados Unidos de América como medicamentos anticáncer.
4. Efectuar estudios farmacofóricos más profundos sobre los cembranoides 2,11-
ciclizados naturales y sintéticos aislados y sintetizados en esta investigación.
45
IV.3 REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Altmann, K-H.; Gertsch, J. Anticancer drugs from nature; natural products as a unique
source of new microtubule-stabilizing agents. Natural Product Reports, 2007, 24,
327–357. Amos, L. Microtubule Structure and its Stabilisation. Organic and Biomolecular
Chemistry. 2004, 2, 2153-2160. Atta, A.; Ankerman, J.; Bayord, A.; Radnika, P. Bioactive Chemical Constituents of
Cladiella Species. Helvetica Chimica Acta. 2004, 87, 592-597. Bayer, F. M., The Shallow Water Octocorallia of the West Indian Region. Martinus
Nijhoff, The Hage, 1961, 373p. Bernardelli, P.; Paquette, L.A. Survey of Oxygenated 2,11 Cyclized Cembranoids of
Marine Origin. Heterocycles. 1998, 49, 531-556. Blagg, J. Structure-Activity Relationships for In vitro and In vivo Toxicity. Annual
Reports in Medicinal Chemistry, Vol. 41, Elsevier Inc. 2006, 353-368. Blunt, J.W.; Copp, B.D.; Hu, W-P.; Munro, M.H.G.; Northcole, P.T,; Prinsep, M.R.
Marine Natural Products. Natural Product Reports. 2007, 24, 31-86. Boik, J. Natural Compounds in Cancer Therapy. Oregon Medical Press, LLC. USA.
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48
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49
IV.4 ANEXOS
ANEXO 1
Extracción, fraccionamiento, separación, purificación de
cembranoides 2,11-ciclizados naturales y síntesis de derivados.
1.1 Briareum asbestinum seco y liofilizado.
1.2 Bomba de alto vacío utilizada en el liofilizador
1.3 Maceración de Fracciones.
1.4 Mezclador y homogenizador del extracto crudo.
50
1.5 Rotaevaporador
1.6 Fraccionamiento de Extractos
1.7 Colección de fracciones
1.8 Monitoreo de fracciones por TLC
51
1.9 Equipo para síntesis orgánica
1.10 Equipo de RMN en Universidad de Puerto Rico
52
ANEXO 2.
Esquema de Aislamiento de Briareum asbestinum.
53
ANEXO 3
Esquema de Farmacóforos de Cembranoides 2,11-ciclizados naturales.
3.1 Esquema del Farmacóforo de Asbestinino 9
3.2 Esquema del Farmacóforo de Asbestinino 20
3.3 Esquema del Farmacóforo de 4-deoxyasbestinino G
54
3.4 Esquema del Farmacóforo de Asbestinino 7
3.5 Esquema del Farmacóforo de Briarellina E
55
ANEXO 4
Esquema de Farmacóforos de Cembranoides 2,11-ciclizados 6-ester urocánicos.
4.1 Esquema del Farmacóforo del 6-ester urocánico de Asbestinino 20
4.2 Esquema del Farmacóforo del 6-ester urocánico de 4-deoxyasbestinino G
4.3 Esquema del Farmacóforo del 6-ester urocánico de Asbestinino 7
56
4.4 Esquema del Farmacóforo del 6-ester urocánico de Briarellina E
57
ANEXO 5
Esquema de Farmacóforos de Cembranoides 2,11-cicizados 6-glucosidados
5.1 Esquema del Farmacóforo de Asbestinino 7 6-glucosidado
58
ANEXO 6
Esquema de Farmacóforos de Cembranoides 2,11-ciclizados
utilizados como comparación.
6.1 Esquema del Farmacóforo de Sarcodictina A
6.2 esquema del Farmacóforo de Sarcodictina B
59
6.3 Esquema del Farmacóforo de Eleutherobina
Clave
Esferas rojas y verdes: Zonas de influencia de grupos polares como Nitrógeno y Oxígeno que
poseen pares de electrones no compartidos que pueden “donar”.
Se diferencian en la “profundidad” de ubicación.
Esferas amarillas: Zonas de influencia de grupos apolares (lipofílicos)
Esferas cafés: Zonas de influencia de grupos lipofílicos en sitios de mayor “profundidad” de
ubicación.
60
ANEXO 7
Survey of 2,11-ciclyzed cembranoids from Caribbean sources
61
PARTE V
V.1 INFORME FINANCIERO
Los recursos financieros fueron ejecutados globalmente en un 88.08%, incluyendo los
provenientes de la línea de financiamiento FODECYT como de la Facultad de Ciencias
Químicas y Farmacia.
En el rubro de Servicios No Personales, los renglones de Estudios, Investigaciones y
Proyectos de Factibilidad (181) es el de mayor monto, ejecutándose el 88.00%, le siguen
el de viáticos al exterior (131), elementos y compuestos químicos (261) y uso de bienes
intangibles (158).
Los tres últimos se ejecutaron en un 100%, utilizándose en los estudios de separación,
aislamiento, obtención de datos espectroscópicos y espectrométricos (Resonancia
Magnética Nuclear de una y dos dimensiones, Espectrometría de Masas y Cromatografía)
realizados en la Universidad de Puerto Rico, Recinto de Río Piedras, la adquisición de
software especializado de modelaje molecular y la adquisición de reactivos químicos
necesarios para los procesos de aislamiento y síntesis orgánica de derivados de los
cembranoides correspondientes.
En el rubro de Propiedad, Planta, Equipo e Intangibles, se ejecutó la totalidad de lo
presupuestado, adquiriéndose equipo de laboratorio con fondos de ambas instituciones,
ascendiendo a Q 37,100.00.
Se adquiere equipo para síntesis orgánica y equipo complementario al existente para la
extracción, destilación y purificación de los compuestos aislados de Briareum asbestinum
y los modificados sintéticamente en el laboratorio.
Se adjunta la ficha financiera correspondiente.