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Que es Online LIMS ?Que es Online LIMS ?• Un LIMS (Laboratory Information Management
System) orientado a laboratorios de enasayo del área minería y medio ambiente.
• Un sistema abierto que permite el analisis de la informacion, hecho para el analista quimico.
• De fácil manejo como una hoja de datos Excel.
• Progreso de cada solicitud codificado por colores y en tiempo real.
• Integrado a un avanzado sistema de control y aseguramiento de calidad.
Concepto de Online WorksheetConcepto de Online Worksheet
OnWSH es una avanzada interfase de cálculo entre uno o más instrumentos de medición y la base de datos del LIMS. Su concepto o idea general se basa en el cuaderno de registros del Químico Analista.
LAB+ instrument link
INITIALIZE READ CANCEL
Instrument ID (Elektrozunge)
OK
Instrument
Status
Device
Test ID (Zucker)Test ID
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Componentes WSHComponentes WSH
OnLINK.EXERecibe la información del instrumento y la transmite via serial a la WSH. Esta pequeña aplicación debe estar activa al momento de medir en línea los datos desde el instrumento.
OnLQC.EXEMódulo de Control de Calidad. Administra y desplega el compartamiento de todas las muestras de control, estándares de referencia y estadísticas para control de calidad.
OnWSH.EXEOnline Worksheet es la interface de cálculo entre los instrumentos y la base de datos.
OnSETUP.EXEAdministra todas las tablas de configuración del LIMS, como lista de usuarios, permisos, librería de análisis, instrumentos, etc.
DLL – dynamic link librariesConjunto de aplicaciones anexas al LIMS.
carpeta BIN
** WSH ** WSH ****
• Hoja de trabajo WorkSheet
• Instrumentos• Aseguramiento de
Calidad y Validación• Exportación.
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Inicio de sesión en LIMS Inicio de sesión en LIMS
Preparándonos para empezar… El primer paso para acceder a cualquier módulo del LIMS, es iniciar sesión en el sistema usando un ID de usuario y una clave personal. Si no se cuenta con una, se deberá solicitar al administrador del LIMS.Ingrese su ID de usuario y clave y presione OK. Si ya ha iniciado sesión dentro de la Red con un único ID de usuario y clave, su ID aparacerá automaticamente como su User ID para el sistema LIMS y en la mayoría de los casos, la clave será la misma que habitualmente usa para iniciar sesión dentro de su Red.
El navegador de WorksheetsEl navegador de Worksheets
El navegador OnWSH porporciona información del estado de la hoja de trabajo en forma de códigos de color:
•Rojo para hojas pendientes•Verde para hojas completadas•Azul para hojas asociadas
Cada uno de esos colores se intensifica cuando el trabajo se ha cerrado o aprobado.
Nombre completo del
archivo
Datos del encabezado
Grupo de trabajo
seleccionado
Identificación de la hoja de
trabajo abreviada
WSH seleccionada
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Barra de herramientas del BrowserBarra de herramientas del Browser
Crear una nueva WSH
Grupo de instrumentos. Elegir de la
lista
Abrir la hoja seleccionada. Doble click o presionar “v”.
Borrar la hoja seleccionada
Iniciar el explorador de clientes
Saltar o ir a la hoja. Presionar
“j” o barra espaciadora
Formato de visualización
Actualizar WSH
Iniciar el filtro de
selección.
Buscar una muestra
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Filtro de datosFiltro de datosEl filtro selecciona un grupo de hojas bajo un parametro
de busqueda
Carpeta del grupo de trabajo
seleccionado(grupo de servicio)
El selector del filtro puede buscar por el criterio de fecha.
Simplemente seleccione el mes del trabajo y cuantos meses atrás
deberán ser incluidos en la búsqueda.
No es necesario ingresar el nombre completo para la
búsqueda Por ejemplo para “dmasson” simplemente escribir
“masson” o “dmas”
Herramienta para buscar muestras dentro de una hoja
especiífica.
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Formato o identificación de la hoja Formato o identificación de la hoja de trabajo en el Browserde trabajo en el Browser
Saltar a la WSH Formato para el nombre del archivo, hay tres disponibles:
1. 5014 (Sólo el numero)2. NV5014 (Mes y número)3. IMS5014-NOV01 (Grupo de trabajo, número, mes y año)
Boton para actualaizar.Ayuda a mantener una vista en tiempo real cuando se ha creado, modificado o eliminado alguna hoja de trabajo otro otro usurario en el sistema.
Escriba la identificación de la hoja a la cual quiere acceder. Se puede escribir de muchas maneras como NOV21 para ir
a NV0021.
Acceso a una hoja de trabajoAcceso a una hoja de trabajo
La hoja se desplega haciendo doble click en ella o bien, presionando la tecla “v”. Aparecerá una ventana con seis viñetas las cuales representan cada una de las
áreas de la hoja.
Encabezado de la hoja de trabajoEncabezado de la hoja de trabajo
Supervisor
Estadísticas de la Hoja.
Pinchando esta viñeta se activa la
sección del encabezado
El encabezado muestra la información principal de la hoja de trabajo
Registro de modificaciones a la hoja
por usuario.
Descripción de la metodología de trabajo
Notas importantes durante el análisis
Registro electrónico equivalente al del químico analista
Despliegue automático
de duplicados
Fórmulas en Formato Excel
Escriba sus anotaciones
Hola de cálculo o WorksheetHola de cálculo o Worksheet
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Plantilla de trabajo en la WorksheetPlantilla de trabajo en la Worksheet
Ejemplo de una plantilla de trabajo para Plomo de Lory
Viñeta de ensayos Viñeta de ensayos (test) (test)
Esta viñeta se usa para asociar un ensayo a una columna (ej: Ag por ICP) en la hoja OnWSH. Cada análisis o ensayo puede tener varios parámetros y la relación
entre ellos está dado por la fórmula ingresada.
Formula de cálculo.Letra minusculas son posiciones relativas a la columna de calculo
Parametros de la
columna
Cifras significativas
Usuario que cerró la columna. Esto no se
puede modificar.
Columna de resultados
Viñeta muestras “sample”Viñeta muestras “sample”
La viñeta “sample” almacena toda la información referente a la muestra. Se una para configurar el nombre de la fila en la hoja de trabajo.
Número y código de JOB Conectado con
LIMS
Archivo de control de
calidad
ID de la secuencia: Conexión al instrumento
Identificación de la muestra
Para propósitos de auditoría, toda la información del
instrumento, incluso calibración, es registrada en el archivo de
eventos.
El archivo de eventos o registros es de sólo lectura y no
puede ser modificado.
Viñeta “instrument” o Viñeta “instrument” o registro de eventosregistro de eventos
Este valor representa la columna y fila donde el dato fué almacenado en
la hoja de trabajo.
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Configuración de la WorksheetConfiguración de la Worksheet
1. Identificación de las muestras (Filas)
2. Creación del test o análisis (Columnas)
3. Fórmulas (Hoja)
4. Formato (Hoja)
Para la configuración de una nueva hoja de trabajo Wsh, son necesarios cuatro pasos :
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1) Identificación de las muestras (Filas)1) Identificación de las muestras (Filas)
El primer paso es ingresar todas las muestras y su identificación incluyendo sus estándares de referencia y duplicados.
Seleccionar el ID del estándar
<CTRL>+<ENTER> En la celda
‘FILE’
Este campo sólo es necesario cuando se
importan datos desde otro archivo o instrumento, como
un autosampler.
Trabajo
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2) Preparación del análisis (Columnas)2) Preparación del análisis (Columnas)
El segundo paso es definir todos los análisis y parámetros que se harán al set de muestras. La columna Roja representa el ensayo y el resultado del análisis, ésta puede ser predefinida desde el Report o escrita directamente. Los datos de la columna de resultados son popularmente obtenidos a partir de la fórmula ingresada en ella . Los parámetros de datos de la columna pueden ser ingresados ya sea manualmente o desde un instrumento.
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3) Fórmula 3) Fórmula (Hoja)(Hoja)
La fórmula en la hoja de trabajo (1) es convertida en una fórmula Excel (2)
Lowercase characters are RELATIVE to the result column.
UPPERCASE characters are ABSOLUTE to the first sheet column.
1
2
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4) Herramientas de Formato (Hoja)4) Herramientas de Formato (Hoja)
Abre el diálogo de formáto
Destacador de las celdas
Selector de cantidad de
decimales o cifras significativas en la
celda.
Protección de las celdas contra
escritura/modidficación
Muestra total o parcialmente la información del
encabezado de la columna
Formatos de Hoja de trabajoFormatos de Hoja de trabajo
Los formatos predefinidos en la creación de hojas de trabajo, son usualmente útiles para ahorrar gran cantidad de tiempo en análisis de rutina. Los formatos predifinidos son
creados como hojas de trabajo las que se graban y almacenan como tal en la carpeta del directorio de trabajo.
Seleccion de un formato y creación
de una nueva hoja.
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Formatos o TemplatesFormatos o Templates
Lista de formatos
Muestra todos los archivos con extensión WSH ubicados en la
carpeta del grupo de trabajo.
Seleccionar NEW para crear una
hoja vacía.
Seleccionar >COPY XXXX<
Para hacer una copia de la hoja seleccionada.
Seleccionar un “template” para crear una nueva
hoja con un formato
predefinido.
Asegurarse de seleccionar el grupo de servicio, mes y
año correctos.
Estos son todos los números
que puede tomar la
nueva hoja de trabajo
en el grupo de servicio.
Seleccionar el numero
de inicio que se desea
para buscar el próximo disponible.
Este menú es usado para la creación de nuevas hojas de
trabajo.
Nombre del archivo seleccionado para la nueva hoja de trabajo
** Instrument **** Instrument **
•Hoja de Trabajo Wsh•Instrumentos•Control de Calidad y Validación•Exportación
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Conexión de Conexión de InstrumentosInstrumentos
INSTRUMENTOS Con Importación de datos
ICPPLASMA
XRFOES
Principalmentemediciones
multielemento
Usan un archivo que se Importa al PC.
INSTRUMENTOS EN LINEA
BalanzasLECO
Espectrofotómetros
Principalmente Instrumentos de Medición en líneapara un elemento
Usa un cable para el Envío de datos al PC
Instrumentos en línea
se conectan por medio de una interfase RS232 (cable serial) al computador o Ethernet en el caso de algunos EAA
Instrumentos con importación de datos
son instrumentos que al final de la sesión de análisis generan un archivo con los datos del analito. Este archivo es importado e ingresado a la hoja de trabajo.
Ajustes para la Ajustes para la medición en línea.medición en línea.
On-line Instruments nos permite la obtención de datos directamente del instrumento o dispositivo de medición y escritura en la Hoja de trabajo.
Para abrir la aplicación ‘on-line instrument’ pinchar en el menú : Instrument->Setup
1. Seleccionar el controlador del Instrumento.2. Seleccionar el ID de instrumento desde la lista.
Esta información deberá estar disponible en la base de datos de instrumentos disponibles. (OnSETUP).
3. Ingresar algún comando de lectura si se requiere.
El archivo de registros de las mediciones es generado.por el instrumento y generalmente se almacena en el disco local. Este registro se usa para recuperar lecturas en caso de pérdida de información por fallas en la red o caída de energía.
Controlador del
instrumento
Identificación del
instrumento
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Online LINK Online LINK
El ícono OnLink debe estar activo
en la barra de herramientas.
OnLINK es una aplicación que maneja la comunicación del puerto serial entre el instrumento y OnWSH. Esta aplicación permanece en activa en memoria (Siempre está presente en la barra de herramientas).
Pantalla que muestra la información entrante a la hoja desde el instrumento
Actual configuración
del puerto
Este parámetro puede ser enviado al
instrumento. Se usa para una comunicación bidireccional
La configuración del puerto serial se activa con el botón “setup”. Se sugiere revisar el manual del instrumento para ingresar correctamentelos parámetros de configuración.
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Importación desde el InstrumentoImportación desde el Instrumento
Vista previa del contenido del
archivo generado por el instrumento
Controlador seleccionado para
las mediciones
Identificación del instrumento en la base de datos.
Ubicación de la carpeta con los datos medidos.
Lista de archivo de datos almacenados en
la carpeta del instrumento.
Visualiza el contenido del
archivo del instrumento en
un editor de texto (Notepad)
El cuadro de diálogo para la importación de datos desde el instrumento se usa para seleccionar y explorar el archivo a importar. El archivo. será procesado por el controlador del instrumento y las lecturas serán enviadas a
la hoja de trabajo, WSH.
30Diagrama de Importación 1Diagrama de Importación 1
a
Las lineas explican como los datos son capturados por el controlador del instrumento y puestos en la hoja de trabajo.
Debido a que este proceso es complejo de entender y más aún explicarlo, es mejor seguir las líneas …
1
2
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Diagrama de Importación 2Diagrama de Importación 2La identificación de la muestra “Sample ID” debe conincidir con la columna “Sequence” en la hoja de trabajo y el test “Analysis Id “ debe coincidir con la columna “Test Id” en la hoja de trabajo. Esto es muy importante para poder conectar correctamente el origen de datos del instrumento con la hoja de trabajo.
La columna “Sequence” debe coincidir con la identificación de la
muestra “Sample ID” según autosampler.
Identificación de la muestra.
Esta columna conecta la hoja de trabajo con el
LIMS. Se explicará en breve…
“Test Id” en la hoja de trabajo debe coincidir con “Test Id”
en el instrumento.
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Base de datos de los InstrumentosBase de datos de los Instrumentos
El propósito principal de esta base de datos, es hacer un seguimiento a los servicios de mantención y calibración de cada instrumento por fecha. Si una de estas fechas expira, en la hoja de trabajo el usuario podrá visualizar la ventana de propiedades del instrumento a modo de alerta.
Los campos adicionales quedan disponibles para almacenar información pertinente..
La base de datos de los insrumentos es mantenida usando el módulo OnSetup.
Este campo se usa como documentación para la
configuración del instrumento.
** QC & ** QC & Validation **Validation **
•Hoja de trabajo Wsh•Instrumentos•Control de Calidad y Validación.•Exportación
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Explorador de Estándares para Control de CalidadExplorador de Estándares para Control de Calidad
En el navegador OnLQC se pueden explorar y editar los parámetros de todos los estándares para el Control de Calidad. Se han creado en tres grupos: Encabezado, Rangos de tolerancia y Nombre (el únco que no puede ser accesado desde el navegador, el cual de divide en tres
paneles).
Identificación de
Estándares
Información del
Estándar.
Rangos de tolerancia para el
Estándar
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Gráfico de Control de CalidadGráfico de Control de Calidad
Información del estándar de ref.
Información estadística general.
Datos del cursor vertical
en el punto seleccionado
Gráfico de datos
Gráfico seleccionado
Cursor horizontal
Cursor vertical
Líneas de desviación
estándar/tolerancia
Barra de información de estado
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Validación de datosValidación de datos
Luego de validar una columna (cerrando la mísma), el
encabezado de la columna toma color
verde y los datos no se pueden
modificar
Cuando se detecta un error en la celda
asignada al estándar de referencia, ésta se colorea en rojo. Los
errores pueden deberse a valores fuera del
rango de aceptación o mala rotulación del test.
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Validación de estándares.Validación de estándares.
Media
Valor certificado Min. y Máx. Permitidos.
El gráfico sólo muestra los últimos 40 valores registrados, pero las estadísticas se basan en toda la población de datos.
Cuando se está desarrollando una validación de estándares de referencia y se encuentra un valor fuera de los rangos establecidos, la ventana de
control de calidad aparece en pantalla.
Controles adicionales con
límites de aceptación
Se puede dejar una nota en este punto
para registrar el origen de la observación.
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Verificación de calidad 2Verificación de calidad 2
Sólo los 40 últimos datos son graficados en la ventana de validación. Para visualizar la población completa, use el modulo OnLQC. Aunque, la estadística está calculada para toda la población de datos, incluyendo el último dato como “dato vivo”. Si se presiona
<accept> , el último dato y la nota registrada es enviada a la base de datos de control de calidad.
Datos de referencia
Overall statistics. Dynamically recalculated as points are added
or hidden in the dataset
Datos para la posición actual del
cursor vertical
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Visualizador de EstándaresVisualizador de Estándares
Es posible obtener una gráfica para cada estándar de referencia con el comportamiento de cada elemento certificado en él.
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Registro de ValidaciónRegistro de Validación
Una vez que los datos en la columna son validados (con el password), sólo pueden ser modificados desbloqueando la columna con el mismo password o con la super clave. Cada vez que una columna es bloqueada o desbloqueada, la acción queda registrada en el campo del encabezado de la hoja.
Cada celda es
auditada.
** Exporting **** Exporting **
•Hoja de trabajo Wsh•Instrumentos•Control de Calidad y Validación•Exportación
La hoja envía (transfiere) los datos a la base de datos LIMS. También es posible visualizar el Report correspondiente a la hoja para asegurar al químico analista que la información fué
correctamente enviada.
Exportación de datos en OnWSHExportación de datos en OnWSH
Las celdas en amarillo, representan los datos que fueron
exitosamente exportados.
Las celdas que no aparecen en amarillo
representan datos que no fueron exportados.
Información del número de datos y test que fueron
exportados.
DATA
Abrir el menú de exportación desde la
barra de herramientas o del menú de datos.
La hoja de trabajo Wsh, exporta todos los datos en formato CSV (valor separado por coma). Sólo los valores son exportados no las fórmulas. El archivo CSV puede ser visualizado en una planilla Excel.
Archivos exportados en Archivos exportados en formato Wshformato Wsh
Al abrir el diálogo de exportación se puede seleccionar la carpeta donde será enviada la
hoja de trabajo.
Este es el archivo “CSV” visto como
texto.
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ImpresiónImpresión
Alternativamente se puede imprimir la hoja
de trabajo Wsh y escribir datos manualmente
como en un cuaderno de registro.
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Gracias por su tiempo !
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