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viernes 30 de marzo
Análisis de correspondencia (o ponderación recíproca)
Capítulo 19 de
McCune y Grace 2002
Extensión de promediación ponderada
• En promediación ponderada:– Las muestras se ordenan de acuerdo a
valores de peso de las especies que estén presentes
– Alternativamente, las especies pueden ordenarse de acuerdo a valores de peso de las muestras
• En ponderación recíproca el proceso se hace primero de una forma y luego de la otra hasta alcanzar una ordenación final única.
Análisis de correspondencia
• Es ponderación recíproca pero utilizando un análisis eigen de manera iterativa.
• Solución final es aquella cuyo residual es igual o menor de 0.0000001
• Las distancias entre muestras en el espacio de ordenación preservan las distancias Chi-cuadradas entre muestras.
Distancia Chi-cuadrada
• Da mayor peso a especies con totales menores
Distancia Chi-cuadrada
• Condiciones para que esta distancia represente gradientes:– Muestras distribuidas homogéneamente– Especies con tolerancias iguales o
independientes de su posición en gradiente– Abundancias en óptimos iguales o
independientes de su posición en gradiente– Optimos distribuidos homogéneamente en
gradiente
• Datos de comunidades violan todas
Análisis eigen
Eigen values:1.065 0.974 0.962
Eigen values:2.631 0.297 0.076
Procedimiento
• 1. Asignar posiciones arbitrarias a las muestras en un eje de ordenación
• 2. Calcular las posiciones de las especies como el promedio ponderado por el total de la especie
• 3. Calcular nuevas posiciones de las muestras por promediación ponderada por el total de la muestra
Procedimiento (cont.)
• 4. Centrar y estandarizar las posiciones
• 5. Cotejar la convergencia entre la primera y la segunda ordanción.
• 6. Aceptar la ordenación que difiera por menos de cierto nivel de tolerancia, o volver al paso 2
Problemas
• Orden adecuado en primer eje pero comprime distancias en extremos y aleja las del medio
• Efecto de arco en primeros 2 ejes y contorciones peores en > 2 ejes.
¿Qué informar?
• Justificación para utilizar distancia chi-cuadrada
• Cuantos ejes fueron interpretados y proporcion de varianza expresada
• Si la solucion fue rotada, cómo.
• Ayudas para interpretación