Simulación de la electroforesis bidimensional en geles de ...€¦ · del ADN La unión de la...

28
Simulación de la electroforesis bidimensional en geles de agarosa con cloroquina en 1ra dimensión María Cristina Parra Aguiar Centro de Investigaciones Biológicas (CIB-CSIC) Facultad Politécnica - UNA 1 / 11

Transcript of Simulación de la electroforesis bidimensional en geles de ...€¦ · del ADN La unión de la...

Simulación de la electroforesis bidimensionalen geles de agarosa con cloroquina en 1ra

dimensión

María Cristina Parra Aguiar

Centro de Investigaciones Biológicas (CIB-CSIC)

Facultad Politécnica - UNA

1 / 11

Efecto de la Cloroquina en la topologíadel ADN

La unión de la cloro-quina al ADN dis-minuye el twist de lamolécula.Para mantener el Lkinvariante, este cam-bio en twist se con-trapone con un cam-bio en el writhe de lamolécula.

∆Lk = ∆Tw+∆Wr ≈ 0

El ADN adquiere Su-perenrollamiento pos-itivo cuando se leagrega cloroquina.

2 / 11

Conociendo la movilidad electroforética enausencia de cloroquina

¿Es posible determinar el cambio en lamovilidad electroforética en presencia de

clorquina?

3 / 11

Efecto de la cloroquina en la movilidadelectroforética de plásmidos circulares

Se analizaran geles bidimensionales donde se colocócloroquina en la 1ra dimensión.

1ra Dim: 0.4 % agarosa, 30 V, 24 horas.2da Dim: 1.0 % agarosa, 150 V, 10-12 horas.Concentraciones de cloroquina durante la 1ra Dim:

sin cloroquina,0.25µg/ml,0.50µg/ml,1.0µg/ml,2.00µg/ml,

4 / 11

Material Biológico

5 / 11

Movilidad electroforéticaen ausencia de cloroquina

6 / 11

Movilidad electroforéticaen ausencia de cloroquina

6 / 11

Interfase

7 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados Preliminares

8 / 11

Resultados estimados para mayoresconcentraciones de cloroquina

9 / 11

Resultados estimados para mayoresconcentraciones de cloroquina

9 / 11

Resultados estimados para mayoresconcentraciones de cloroquina

9 / 11

Resultados estimados para mayoresconcentraciones de cloroquina

9 / 11

Geles bidimensionales con cloroquina en 2dadimensión

Geles bidimensionalesrealizados con plás-midos de E-coli yS-cerevisiae de dis-tintas longitudes ycon distintas concen-traciones de cloro-quina en la 2da di-mensión.

10 / 11

11 / 11

11 / 11

11 / 11

11 / 11

11 / 11

11 / 11