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Rol del laboratorio en infecciones respiratorias
(contexto COVID-19)Dr. Cristian Pérez Corrales
ARSDT-CNLCCCSS – 2020
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Dr. Cristian Pérez C.
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¿Por qué?
• Comprensión de patrones de transmisión
• Gravedad
• Características clínicas
• Factores de riesgo de infección
• Afección en poblaciones• General
• Trabajadores de salud
• Entorno familiar
• Ambiente
Reducidas
https://www.who.int/emergencies/diseases/novel‐coronavirus‐2019/technical‐guidance/early‐investigationsDr. Cristian Pérez C.
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En contextoEvidencia (>100 000 casos) COVID-19 Influenza
Presentación clínica Asintomática, moderada, grave, muerte
Asintomática, moderada, grave, muerte
Transmisión Contacto, gotículas, fomites Contacto, gotículas, fomites
Prevención Higiene de manos, protocolo de estornudo
Higiene de manos, protocolo de estornudo
Intervalo de serie (tiempo entre casos)
5-6 días 3 días
Transmisión pre-sintomática ± 48 horas* 3-5 días
R0 2-2.5* 1.2-1.6
Grupos más afectados Adultos > 55 años + Factores de riesgo
Niños, embarazadas, adultos con factores de riesgo
Mortalidad 3-4 % * 0.1%
* Información en desarrollo.
WHO. Coronavirus COVID-19 Situation report - 46Dr. Cristian Pérez C.
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Rol del laboratorio
Recepción y atención de pacientes
Toma de muestras
Embalaje y transporte de muestras
Procesamiento de muestras
Comunicación de resultados
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Recepción y atención de pacientes
• Ventanilla• Barrera de contención
• >1 m
• Higiene de manos
• Limpieza de superficies
• Bolsas de bioseguridad
• Manejo de derrames
• EPP disponible
• Comunicación
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Derrames
Pequeño
Colóquese guantes
Limpie con toalla con cloro 0.5%
Descarte toalla y limpie
Retire guantes
Higiene de manos
Grande
Colóquese guantes
Cubra con toallas
Agregue cloro 0.5% de fuera hacia adentro
Deje por 10 minutos
WHO, 2004. Laboratory Biosafety Manual. 3rd Ed. 2004.WHO. 2020. Laboratory biosafety guidance related to coronavirus disease 2019 (COVID-19): interim recommendations
Otros desinfectantes:Etanol 70%Peróxido 0.5%Sales de aminio 4°
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Recolección y manipulación de muestras• Toda muestra → POTENCIALMENTE INFECCIOSA
• Personal:• Equipo de protección personal completo en sospechosos para toma de hisopado
• Gafas• Guantes• Gabacha manga larga• N95• Higiene de manos
• Ambiente• Desinfección de áreas antes y después del procedimiento• Procedimiento de descontaminación de derrames
• Transporte:• Embalaje triple
• Otras muestras• Mascarilla quirúrgica en paciente y en trabajador• EPP estándar
OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales
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Antes de colocar su EPP recuerde• Colocar en toma de muestra
• Bolsa para descarte del EPP
• Materiales para el embalaje
• Pilot/Rotulador
• Etiquetas adhesivas
• Alcohol
• Desinfectante en aerosol si está disponible
• Toallas de papel
• DOBLE GUANTE
• Cloro
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Tipos de muestra y transporte
WHO. 2020. Laboratory testing for coronavirus disease 2019 (COVID-19) in suspected human cases
Tipo de muestra Material de recolección Almacenamiento Temperatura de transporte
Hisopado nasofaríngeo Hisopo flocado, Dacrón 2-8 °C 2-8 °C
LBA Contenedor estéril 2-8 °C 2-8 °C
Aspirado nasofaríngeo Contenedor estéril 2-8 °C 2-8 °C
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Toma de muestra
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Necesidades de hisopos:1. Supervisor regional. 2. SR consolida y envía a la Coordinación Nacional LC.3. CNLC coordina con la Dirección de Red4. DR coordina con ALDI
Muestras (v 7)Aspirado NasofaríngeoHisopado nasofaríngeoLBA y otros
Lineamientos Nacionales para la Vigilancia de la enfermedad COVID-19. v 7.0
Tipos de Muestra (v 7)
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Embalaje de muestras para transporte• Muestra identificada
• Bolsa hermética
OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales PAHO 2020. Directrices provisionales de bioseguridad de laboratorio para el manejo y transporte de muestras asociadas al nuevo coronavirus 20191 (2019-nCoV)
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OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales PAHO 2020. Directrices provisionales de bioseguridad de laboratorio para el manejo y transporte de muestras asociadas al nuevo coronavirus 20191 (2019-nCoV)
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OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales PAHO 2020. Directrices provisionales de bioseguridad de laboratorio para el manejo y transporte de muestras asociadas al nuevo coronavirus 20191 (2019-nCoV)
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OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales PAHO 2020. Directrices provisionales de bioseguridad de laboratorio para el manejo y transporte de muestras asociadas al nuevo coronavirus 20191 (2019-nCoV)
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OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales PAHO 2020. Directrices provisionales de bioseguridad de laboratorio para el manejo y transporte de muestras asociadas al nuevo coronavirus 20191 (2019-nCoV)
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OMS, 2020. Prevención y control de infecciones durante la atención sanitaria de casos en los que se sospecha una infección por el nuevo coronavirus (nCoV): orientaciones provisionales PAHO 2020. Directrices provisionales de bioseguridad de laboratorio para el manejo y transporte de muestras asociadas al nuevo coronavirus 20191 (2019-nCoV)
Dr. Cristian Pérez C.
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Procesamiento de las muestras
• Procedimientos de rutina• Hacer evaluación de riesgo
• Determinar puntos críticos de riesgo
• Mantener precauciones estándar en• Manipulación
• Riesgo de salpicaduras
• Riesgo de derrame
• Procedimientos específicos• Centrifugación
• Apertura de tubos
• Introducción a equipos
• Microscopía
WHO. 2020. Laboratory biosafety guidance related to coronavirus disease 2019 (COVID-19). Dr. Cristian Pérez C.
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Hospital Escalante Pradilla
AS Corredores
Hospital Tony Facio
AS Talamanca
AS La Cruz
AS Paraíso
AS Los Chiles
AS Los Santos
AS Oreamuno
Hospital Max Peralta
Hospital Enrique Baltodano
AS Barranca
Hospital Monseñor Sanabria
AS La Fortuna
Hospital San Carlos
AS Pavas
Hospital San Vicente Paul
Regional Hospital
Primary Care Center
Especialized Hospital
National Influenza Center (Inciensa)
CNI, CNR
Virología,
Inciensa
Fortalecimiento de la red Institucionalde vigilancia de virus respiratorios basada en
laboratorio
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Hospital Escalante Pradilla
AS Corredores
Hospital Tony Facio
AS Talamanca
AS Paraíso
Hospital Max Peralta
Hospital Enrique Baltodano
Hospital Monseñor Sanabria
CENTROS ccDM
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Hospital Escalante Pradilla
Hosp Villa Neilly
Hospital Tony Facio
Hospital Max Peralta
Hospital Enrique Baltodano
Hospital Monseñor Sanabria
Hospital San Carlos
HSRA
Hospital San Vicente Paul
H. Nacional
Niños
Hospital ccDM
CD COVID-19
HSJD
HMex
H Guapiles
Fuente: Dra. Guiselle Guzmán. ASC
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ActividadActores / Responsables
Médico tratante
Personal designado
Red de Laboratorios Clínicos CCSS
INCIENSAObservaciones
4. ¿El Laboratorio Clínico del establecimientode salud dispone de diagnóstico molecularpara virus respiratorios?
1. Inicio
2. Identifica un caso sospechoso por COVID-19 e indica toma de muestra.
5. Embala la muestra y la envía al LaboratorioClínico de su red de servicios de salud quedisponga de diagnóstico molecular.
6. Procesa la muestra para diagnóstico devirus respiratorios y coordina el registro delos resultados en el PAHO-FLU con laComisión Local de Vigilancia Epidemiológica.
Si
No
En la solicitud de análisis hacia elLaboratorio de referencia debe indicarse losmedios de contacto del Laboratoriosolicitante para que se les informe de losresultados.
Consultar Guía práctica de trabajo para losLaboratorios Clínicos institucionales para larecepción, toma, embalaje y transporte demuestras respiratorias para análisis de virusrespiratorios.
3. Toma la muestra para diagnóstico de virusrespiratorios.
7. Reporta los resultados al LaboratorioClínico o establecimiento de salud solicitantesegún los medios de contacto indicados en lasolicitud.
La persona designada en el LaboratorioClínico o establecimiento de saludsolicitante debe informar los resultados alepidemiólogo local.
Completa la ficha R85.
Créditos: Ing. Andrey Mora Bermúdez
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ActividadActores / Responsables
Médico tratante
Personal designado
Red de Laboratorios Clínicos CCSS
INCIENSAObservaciones
11. Procesa la muestra para análisis deCOVID-19 y coordina el registro de losresultados en el PAHO-FLU con la ComisiónLocal de Vigilancia Epidemiológica.
8. ¿El resultado de Laboratorio es positivopara los patógenos analizados?
9. ¿El Laboratorio Clínico dispone de análisismolecular por COVID-19?
12. Reporta los resultados al LaboratorioClínico o establecimiento de salud solicitantesegún los medios de contacto indicados en lasolicitud.
En la solicitud de análisis hacia elLaboratorio de referencia debeindicarse los medios de contacto del ode los Laboratorios solicitantes para quese les informe de los resultados.
En caso afirmativo se continúa con larevaloración clínica y abordaje delpaciente, así como la re-valoraciónepidemiológica cuando corresponda.
La persona designada en el LaboratorioClínico o establecimiento de saludsolicitante debe informar los resultadosal epidemiólogo local.
10. Deriva la muestra al INCIENSA o alLaboratorio Clínico de su red de servicios desalud que disponga del análisis COVID-19.
13. ¿Los resultados de la prueba COVID-19son positivos?
En caso negativo continúa con la re-valoración médica y abordaje delpaciente.
Si
No
A
No
Si
14. Remite la muestra al INCIENSA paraconfirmación diagnóstica
Si
NoA
En la solicitud de análisis haciaINCIENSA debe indicarse los medios decontacto de los Laboratoriossolicitantes para que se les informe delos resultados.
B
Créditos: Ing. Andrey Mora Bermúdez
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ActividadActores / Responsables
Médico tratante
Personal designado
Red de Laboratorios Clínicos CCSS
INCIENSAObservaciones
17. Continúa con el abordaje del paciente deacuerdo con los protocolos institucionales.De ser necesario se reinicia en la actividad 2.
15. Procesa la muestra y analiza losresultados.
16. Reporta los resultados al LaboratorioClínico o establecimiento de salud solicitantesegún los medios de contacto indicados en lasolicitud.
18. Fin
La persona designada en elLaboratorio Clínico oestablecimiento de saludsolicitante debe informarlos resultados alepidemiólogo local.
B
A
Créditos: Ing. Andrey Mora Bermúdez
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Importante
• Actualizar datos en Inciensa:• [email protected]
Dr. Cristian Pérez C.
Nombre de responsable
Teléfono Correo electrónico
Laboratorio
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Fortalecimiento de la red de vigilancia de virus respiratorios basada en laboratorio
Dr. Cristian Pérez C.
FilmArray existentes1. Hmex2. HNN3. HSJD4. HSRA5. HEBB6. HMP7. HCG8. HMS
Nuevos FilmArray8. HSC9. H Guápiles10. HTF11. Hciudad Neilly12. HEP13. Hosp Heredia14. Respaldo
COVID-19 CR1. Hmex2. HNN3. HSJD
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Diagnóstico molecular
• FilmArray
BioFire Diagnostics. BioMerieux
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BioFire Diagnostics. BioMerieuxDr. Cristian Pérez C.
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PCR COVID-19
CDC. 2020. Real-Time RT-PCR Panel for Detection 2019-Novel CoronavirusDr. Cristian Pérez C.
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Seegene. COVID-19 PanelDr. Cristian Pérez C.
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Dr. Cristian Pérez C.
GRACIAS