Estudio del metagenoma de un consorcio degradador de hidrocarburos
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Transcript of Estudio del metagenoma de un consorcio degradador de hidrocarburos
Facultad de ingeniera QumicaIngeniera en BiotecnologaBioinformticaDr. Rafael Rojas HerreraDr. Michel Canul Chan
Proyecto finalPresentado por:Carlos Cauich CrdovaThomas Ramos Sosa
Diciembre de 2014
ContenidoMetagenoma 12Distribucin de las 10 familias ms abundantes2Distribucin de los 10 gneros ms abundantes3Distribucin de las 10 clases ms abundantes3Metagenoma 23Distribucin de las 10 familias ms abundantes4Distribucin de los 10 gneros ms abundantes4Distribucin de las 10 clases ms abundantes5Metagenoma 36Distribucin de las 10 familias ms abundantes6Distribucin de los 10 gneros ms abundantes6Distribucin de las 10 clases ms abundantes7
Reporte de los metagenomasPara cada uno de los 3 metagenomas en el MG-RAST se obtuvo lo siguienteMetagenoma 1Distribucin de las 10 familias ms abundantes
Distribucin de los 10 gneros ms abundantes
Distribucin de las 10 clases ms abundantes
Metagenoma 2
Distribucin de las 10 familias ms abundantes
Distribucin de los 10 gneros ms abundantes
Distribucin de las 10 clases ms abundantes
Metagenoma 3Distribucin de las 10 familias ms abundantes
Distribucin de los 10 gneros ms abundantes
Distribucin de las 10 clases ms abundantes
Curva de rarefaccin de los 3 metagenomas
Figura 1. Curva de rarefaccin de los 3 consorcios, la lnea azul representa el tercer consorcio, la lnea roja representa al segundo consorcio, la lnea naranja representa al primer consorcio
ndice de diversidad para cada consorcio
Figura 2. ndice de diversidad para el primer consorcio
Figura 3. ndice de diversidad para el segundo consorcio
Figura 4. ndice de diversidad para el tercer consorcio.Se realiz una comparacin de igual manera de los 3 metagenomas, para este caso se hizo con el metabolismo de los aminocidos, ya que en los 3 se encuentra un alto porcentaje, en comparacin con los otros metabolismos.
Figura 5. Metagenoma 1, mostrado en Krona View
Figura 6. Metagenoma 2, mostrado en Krona View
Figura 7. Metagenoma 3, mostrado en Krona ViewLos 3 presentaron un alto valor en el metabolismo de la serina, treonina y glicina, ms altos que en los otros que se presentaron por lo cual se eligi este como subsistema de inters.De la cual el dihydrolipoamide dehydrogenase, presenta la mayor abundancia para los 3 metagenomas y por ende el mayor porcentaje en los mismos.9