Curso M7: MICROBIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR Coordinador: Dr. Félix J. Sangari. IBBTEC CSIC/Universidad de Cantabria 14-25 de Noviembre 2016

MÁSTER UNIVERSITARIO EN

BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOMEDICINA

MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOMEDICINA Curso 2016-2017

MICROBIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR

Biología Celular Biología Molecular

Microbiología

Microbiología Molecular

Microbiología Celular

Microbiología Molecular Estudia las bases moleculares de los procesos fisiológicos de los microorganismos.

Microbiología Celular Microbiología + Biología Celular. Estudia la patogenicidad de los microorganismos mediante técnicas de Biología Celular, y a los patógenos como herramientas de Biología Celular.

Profesorado Félix J. Sangari IBBTEC / UNICAN Juan Mª García Lobo IBBTEC / UNICAN Asuncion Seoane IBBTEC / UNICAN Alberto Sánchez Díaz IBBTEC / UNICAN Raúl Fernández López IBBTEC / UNICAN Gabriel Moncalian IBBTEC / UNICAN Matxalen Llosa IBBTEC / UNICAN Mª Cruz Rodríguez IBBTEC / UNICAN M. Ignacio González-Carrero UNICAN Iñigo Casafont Parra UNICAN Jesús Agüero Balbin UNICAN / HUMV Alain Ocampo UNCIAN / HUMV Vladimir Kaberdin EHU Craig R. Roy YALE

Temario

Microbiología Molecular Procesos fundamentales Genómica y transcriptómica Sesión práctica

Microbiología celular Entorno clínico Diagnóstico, Epidemiología Resistencias

Estructura de la clase 1 hora 15’- 1 hora 30’ de revisión estructurada del tema 15’-30’ explicando un artículo, su metodología y conclusiones

Actividades presenciales 36 Horas obligatorias de clases, actividades prácticas, discusión de trabajos 4 Horas Presentaciones de los alumnos Cada alumno tiene un tutor No presenciales Elaboración de un trabajo final, preparación de las clases, estudio, etc. hasta 250 horas totales.

Tema 1. Replicación y Transcripción en bacterias Tema 2. Transferencia genética horizontal. Conjugación bacteriana y plásmidos. Mecanismos de defensa frente al ADN exógeno. Sistema CRISPR/Cas Tema 3. Secuenciación masiva. Tecnologías. Métodos. Secuenciación de genomas bacterianos. Metagenómica. Tema 4.Técnicas de microscopía en Microbiología Molecular y Celular Tema 5. Postranscriptional regulation of gene expression. sRNAs Tema 6. Plasticidad del genoma bacteriano. Recombinación general y sitio-específica. Integrones. Trasposición. Trasposones Sesión práctica Uso de Artemis. Instalación, descarga de genomas. Funciones. Anotación. ACT. Aplicaciones genómicas y transcriptómicas. Suite Blast+.

Tema 7. Adherencia bacteriana a las superficies celulares y a la matriz extracelular. Fimbrias, Otras Adhesinas, Papel de la adhesión en la infección. Motilidad. Tema 8. Bacterial Secretion Systems. Tema 9. Intracellular bacterial pathogens and autophagy. Tema 10. Proteínas Rab y el control del tráfico intracelular. Tema 11. La inmunidad nutricional y su gestión en el diseño de nuevos antibióticos.

Tema 12. Estudio y aprovechamiento clínico de los mecanismos de la división celular en Saccharomyces cerevisiae. Tema 13. Diagnóstico microbiológico molecular. Métodos basados en hibridación. PCR, modalidades. Control de calidad. Aplicaciones. Comparación con métodos tradicionales. Tema 14. Tipado molecular de microorganismos de interés clínico. Electroforesis en campos pulsados. Tipado por secuenciación de múltiples loci (MLST). Secuencias repetidas y tipado molecular. Tema 15. Resistencia a antibióticos. Mecanismos de resistencia, Inactivación. Alteraciones en la permeabilidad. Alteración de la diana. Tema 16. Determinación de la susceptibilidad en el laboratorio clínico. Problemas clínicos más serios derivados de la resistencia.

Recursos online https://aulavirtual.unican.es/

Recursos online https://aulavirtual.unican.es/

Criterios y Procedimientos de Evaluación Asistencia y participación: Hasta un 50% de la nota final.

Recuperable. Tema asignado y memoria del mismo: Hasta un 50% de la nota final. La asistencia a la sesión de evaluación es obligatoria y necesaria para superar el curso.

Clases y Trabajo Fin de Máster

Clases y Trabajo Fin de Máster

Clases y Trabajo Fin de Máster

Clases y Trabajo Fin de Máster

OBJETIVOS: Habilidades específicas (E) y transversales (T) a adquirir por los estudiantes E1. Conocer los avances más recientes del conocimiento en el área de la Microbiología E2. Conocer las tecnologías disponibles y su aplicabilidad al campo de la investigación en Microbiología E3. Ser capaz de plantear y abordar un tema de investigación en el campo de la Microbiología T1. Lectura y utilización de trabajos de investigación en inglés T2. Análisis y discusión crítica de trabajos de investigación T3. Presentación oral, elaboración y uso de materiales audiovisuales

Hay muchísimas razones para hacer este curso y un trabajo de master relacionado en el IBBTEC/UC

Microbiología Molecular y Celular

Actividades presenciales 36 Horas obligatorias de clases, actividades prácticas, discusión de trabajos 4 Horas Presentaciones de los alumnos Cada alumno tiene un tutor No presenciales Elaboración de un trabajo final, preparación de las clases, estudio, etc. hasta 250 horas totales

MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOMEDICINA Curso 2014-2015

Juan M García IBBTEC Asunción Seoane IBBTEC Félix J. Sangari, PhD Maria Cruz Rodríguez Gabriel Moncalián, PhD Manuel IG Carreró, PhD Jesús Agüero, MD Craig R. Roy Kaberdin

Profesores del curso:

Microbiología Molecular y Celular

MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOMEDICINA Curso 2014-2015

Programa:

Microbiología Molecular y Celular

MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOMEDICINA Curso 2014-2015

17/11 Tema 1

Secuenciación masiva. Tecnologías. Métodos. Secuenciación de genomas bacterianos. Transcriptómica, análisis transcripcional en bacterias. Metagenómica .

18/11 Tema 2

(Práctico) Uso de Artemis. Instalación, descarga de genomas. Funciones. Anotación. ACT. Aplicaciones genómicas y transcriptomicas

19/11 Tema 3

Replicación y transcripción. Enzimas involucaradas, Mecanismos y regulación

20/11 Tema 4

Plasticidad del genoma bacteriano. Mutación. Recombinación general y sitio-específica. Trasposición. Trasferencia génica. Integrones, trasposones y plásmidos

21/11 Tema 5

Adherencia bacteriana a las superficies celulares y a la matriz extracelular. Fimbrias, Otras Adhesinas, Papel de la adhesión en la infección. Motilidad.

24/11 Tema 6 Sistemas de Secreción de proteínas. Tipos, arquitectura y

mecanismos. Análisis y aplicaciones.

Microbiología Molecular y Celular

MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOMEDICINA Curso 2014-2015

25/11 Tema 7 Microorganismos endosimbiontes y su papel en el equilibrio “salud-

enfermedad”.

Tema 8 Tema 8. Gestión de la “inmunidad nutricional” en el diseño de nuevos antibióticos. El papel de los metales.

26/11 Tema 9

Diagnóstico microbiológico molecular. Métodos basados en hibridación. PCR, modalidades. Control de calidad. Aplicaciones. Comparación con métodos tradicionales.

Tema 10 Tipado molecular de microorganismos de interés clínico. Electroforesis en campos pulsados. Tipado por secuenciación de múltiples loci (MLST). Secuencias repetidas y tipado molecular.

27/12 Tema 11 Resistencia a antibióticos. Mecanismos de resistencia, Inactivación.

Alteraciones en la permeabilidad. Alteración de la diana. Tema 12 Genes de resistencia. Adquisición de resistencia ; mutación, transferencia.

Evolución de genes de resistencia, Tema 13 Determinación de la susceptibilidad en el laboratorio clínico. Problemas

clínicos mas serios derivados de la resistencia 28/11 EVALUACION/Presentaciones de los alumnos

Posibilidades de hacer el Trabajo de Máster en los grupos de investigación relacionados

Interés en investigación del grupo de Microbiología UC

•  Crecimiento intracelular de Brucella •  Genómica comparativa de α-proteobacteria •  Transcriptomica •  Regulación mediada por RNA

360 5’UTRs 142 sRNAs 90% no observados antes

EXPRESIÓN DIFERENCIAL

140 genes inducidos (2973) 778 genes reprimidos

PROGRAMA DE INVESTIGACIÓN PARA LA CONSERVACIÓN PREVENTIVA Y RÉGIMEN DE ACCESO DE LA CUEVA DE ALTAMIRA (2012-2014)

Aerobiología

Clasificacióntaxonómica:Bacterias/orden

Colonización de las paredes Microbiología de aguas