Curso Bioquímica 11-Enzimas

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Enzimas Antonio E. Serrano PhD. MT. Cátedra de Bioquímica - 2012 @xideral xideral.com

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Enzimas Antonio E. Serrano PhD. MT.Cátedra de Bioquímica - [email protected]

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Sumario• Características• Nomenclatura• Cofactores• Inorgánicos• Orgánicos

• Sitio Activo• Unión Enzima Sustrato• Catálisis

• Clasificación• Inhibición Enzimática• Control Actividad Enzimática

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Características• 1.- Catálisis:• Aceleran las reacciones

químicas aumentando la velocidad de reacción

• 2.- Especificidad• Tanto en la reacción que

catalizan como en la selección de los Sustratos.

• 3.-Casi todas las Enzimas conocidas son proteínas• Existen moléculas de RNA

catalíticamente activas (Ribozimas).

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Caracteristicas• 4.- Las enzimas no se

modifican en la reacción que catalizan.• 5.- No afectan el

equilibrio de la reacción• Sólo la velocidad.

• 6.- Algunas requieren de moléculas inorgánicas u orgánicas para la catálisis• Cofactores• Coenzimas

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Nomenclatura• Son llamadas de acuerdo a:• Nombre del sustrato que ellas utilizan• En algunas ocasiones al tipo de reacción que realizan

• Ejemplo• Enzima de la Glicólisis – Hexoquinasa (Hexosa y Quinasa)• La hexoquinasa es la enzima que cataliza la primera reacción de la

vía glucolítica

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Co-Factores• La actividad catalítica de muchas enzimas depende de

moléculas llamadas cofactores.• Apoenzima + cofactor = Holoenzima (activa)

• Se dividen en dos grupos:• Cofactores: Inorgánicos (Metales)• Coenzimas: Pequeñas moléculas orgánicas

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Cofactores Inorgánicos• Su mecanismo de acción

comprende:1. No participando en la

transformación del sustrato:• a) Puede servir de puente entre

el Sitio Activo y el Sustrato (interacción iónica)

• b) Activación de la enzima por unión del cofactor

2. Participando en la transformación del sustrato:• Principalmente en reacciones

REDOX (óxido-reducción)

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Cofactores Inorgánicos

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Coenzimas (Cofactores Orgánicos)

• Participan directamente en la reacción enzimática.• Actúan como transportadores de grupos funcionales

específicos.

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FAD

Ácido fólico

Coenzimas

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Mecanismo de Acción

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Sitio Activo• Zona de la enzima a la

que se une el sustrato para ser catalizado

• Bolsillo o depresión en la estructura de la enzima

• Pequeño y superficial• La reacción específica

que una enzima controla depende de un área de su estructura terciaria

• Grupos R importantes para interacción y catálisis

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Grupos R del Sitio Activo

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Unión Enzima-Sustrato

Modelo Llave- Cerradura (1890)

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Unión Enzima-Sustrato

Modelo Encaje Inducido (1958)

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Variación Actividad Enzimática

Efecto del pH

• Afecta al estado de disociación de los grupos R.

• La mayor parte de los enzimas tienen un pH óptimo.

• El pH puede afectar de dos maneras:• Afecta a la unión del sustrato.• Afecta a la velocidad catalítica

de la reacción.

Temperatura

• Cuando la temperatura sube la velocidad de reacción aumenta. Existe una temperatura máxima a la cual la proteína se denatura dejando de ser funcional.

• La mayor parte de los enzimas se denatura a unos 50ºC.

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Etapas de la Catálisis1. Se forma el Complejo

Enzima-Sustrato.2. Los sustratos se unen a las

enzimas en una cavidad denominada Centro Activo (interacciones hidrofóbicas, puente de hidrógeno, iónicas, fuerzas de van der Waals).

3. Grupos Catalíticos: residuos aminoacídicos del Centro Activo que participan directamente en la producción y ruptura de enlaces.

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Interacciones en la Catálisis

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Lugar de Unión

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Clasificación de Enzimas

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Clasificación de Enzimas• 1.- Oxido-reducción: hay transferencia de electrones

• 2.- Transferasas: Transferencia de Grupos. Ejemplo: grupos Fosfato

• 3.- Hidrolasas: Reacciones de hidrólisis• Enlace éster• Enlace glucosídico• Enlace peptídico• Enlace C-N

• 4.- Liasas: Ejemplo: Formación de dobles enlaces.

• 5.- Isomerasas: Transferencia de grupos dentro de una molécula para generar isómeros.

• 6.- Ligasas: Formación de enlaces con aporte de ATP• Entre C y O• Entre C y S• Entre C y N• Entre C y C

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Reacción Enzimática catalizada por la Lisozima

Ejemplo de Reacción Enzimatica

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Reacción Enzimática catalizada por la Lisozima

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Inhibición Enzimática• Las enzimas son inhibidas por

moléculas específicas.• Principal mecanismo de

control en los Sistemas Biológicos.

• Inhibición Irreversible: el inhibidor se une covalentemente a la enzima.

• Inhibición Reversible: hay una rápida disociación del Complejo enzima-inhibidor (uniones no covalentes).• Competitiva • No Competitiva

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Inhibición Reversible Competitiva

• Inhibición que se supera aumentando la concentración del sustrato

• Inhibidor tiene estructura similar al sustrato

• Medicamentos, antibióticos, pesticidas, herbicidas=algunos actúan como inhibidores enzimáticos (reversibles e irreversibles).

• Existen Activadores Enzimáticos.

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Inhibición Reversible No Competitiva

• El Inhibidor se une a un sitio alostérico.• Varía la estructura

terciaria de la enzima.

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Inhibición Competitiva

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También puede haber unión del I sólo a la E.

No se forma producto aunque el sustrato se una a la enzima (por la presencia del inhibidor).

Inhibición No Competitiva

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Control de la Actividad Enzimática

• 1.- Interacciones Alostéricas (interacciones entre centros espacialmente distintos)

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Control de la Actividad Enzimática

• 2.-Modificación Covalente Reversible (fosforilación de residuos de serina y treonina)

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Control de la Actividad Enzimática

• 3.- Actividad Proteolítica (enzimas digestivas como tripsinógeno – tripsina - Sheddasas)