BIOCHEM.12.1.14

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UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS FACULTAD DE QUÍMICA E INGENIERÍA QUÍMICA BIOQUÍMICA FRED GARCÍA ALAYO, Ph.D. Mg. JUAN CARLOS WOOLCOTT HURTADO

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bioquimica

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  • UNIVERSIDAD NACIONAL

    MAYOR DE SAN MARCOS

    FACULTAD DE QUMICA E

    INGENIERA QUMICA

    BIOQUMICA

    FRED GARCA ALAYO, Ph.D.

    Mg. JUAN CARLOS WOOLCOTT HURTADO

  • CICLO DEL NITRGENO

    N2 atmosfrico Fijacin

    Industrial

    NITRATOS

    Atmosfrica Biolgica

    Productores Consumidores

    Descomponedores

    Disolucin y

    transporte

    Medio

    acutico

    Procesos de putrefaccin de la

    materia orgnica muerta

    NH3

    Erupciones

    volcnicas

    Bacterias desnitrificantes

    Pseudomonas, Alcaligenes, Thiobacillus, Bacillus

  • CICLO DEL NITRGENO El nitrgeno libre forma el 78 % de la atmsfera

    El nitrgeno inerte es prcticamente inaccesible para la mayora de los seres vivos.

    Otros componentes atmosfricos: NH3, de las emanaciones volcnicas, y NOx que se forman en las tormentas elctricas

    Fijacin industrial: por el mtodo Haber-Bosch: se pasa del N2 a formas activas de forma parecida a la fijacin atmosfrica y a la

    combustin a altas temperaturas amonaco y fertilizantes

    Fijacin atmosfrica: tormentas elctricas

    Fijacin biolgica: bacterias y hongos que transforman el N2 atmosfrico en nitratos disponibles para las plantas:

    Bacterias: Azotobacter (suelo), cianobacterias (fitoplancton) y Rhizobium (simbiosis en las races de leguminosas)

    Hongos: gen. Frankia, actinomiceto que forma ndulos radiculares con rboles como el aliso

    La mayor parte del nitrgeno disponible para los seres vivos (93%) procede de la actividad de los descomponedores

  • CICLO DEL NITRGENO

  • REDUCCIN DEL NITRGENO:

    DINITROGENASA

    Clostridium y Rhizobium

    Protena Mo y Fe

    Protena S y Fe

  • CICLO DEL NITRGENO 1. Bacterias que fijan el nitrgeno, reducen el gas N2 en amoniaco

    2. El amoniaco en presencia de agua se convierte en amonio

    3. El amoniaco generado en el suelo por fijacin de N2 lo utilizan plantas y animales superiores; pero la mayor parte se oxida a nitritos por los m.o (Nitrosomonas)

    2 NH3 + 3 O2 2 NO2- + 2 H2 O + 2 H

    +

    4. Nitrobacter continua la oxidacin de nitritos a nitratos

    2 NO2- + O2 2 NO3-

    5. Pasos 3 y 4 representan la nitrificacin

    6. El nitrgeno tambin entra al suelo por las tormentas elctricas

    O2 O2 O2 N2 2 NO 2 NO

    2- 2 NO3-

    7. Las bacterias del suelo y plantas revierten el proceso de nitrificacin por reductasas

    Nitrato reductasa

    NO3- + NADPH + H+ NO2

    - + NADP+ + H2O

    Nitrito reductasa

    NO2- + 3NADPH + 4H+ NH4

    + 3NADP+ + H2O + OH-

  • CICLO DEL NITRGENO

    8. Los iones amonio formados en el suelo por reduccin y fijacin de nitrgeno lo utilizan plantas para sintetizar aa.

    9. Aunque los animales pueden utilizar los iones de amonio, todo el nitrgeno lo obtiene a travs de la cadena alimenticia.

    10. El nitrgeno de las plantas y animales se recicla en el suelo: El N excretado como urea o cido rico se transforma en amoniaco por

    accin de M.O.

    Protenas y otros componentes nitrogenados de los animales y plantas muertos que estn en proceso de descomposicin son hidrolizados en aa y otros compuestos.

  • FIJACIN DEL NITRGENO La fijacin biolgica de N se consigue a travs del complejo de la

    nitrogenasas.

    El complejo esta formado por: -Nitrogenasa reductasa

    Su centro redox tiene 2 Mo, 32 Fe, y 30 S. -Dinitrogenasa

    Tiene dos centros de unin a la reductasa y los 8 electrones necesarios se transfieren a la dinitrogenasa uno a uno dando lugar a un ciclo en que la forma reducida de la reductasa se une a la dinitrogenasa, mientras que la forma oxidada de la reductasa se separa.

    Se requiere ATP que es ms que todo cataltico.

  • OXIDACIN DE AMINOCIDOS ltimas biomolculas que contribuyen a la generacin de energa

    metablica.

    La energa metablica varia segn el tipo de organismo.

    Los carnvoros hasta 90% de su necesidad

    La mayora de los M.O pueden nutrirse de aa del entorno en caso estn disponibles.

    Las plantas fotosintticas no oxidan aa o raramente.

    Los aa en plantas estn reguladas para cubrir necesidades de biomolculas.

    En animales los aa se degradan oxidativamente en 3 situaciones metablicas diferentes:

    1. Durante la sntesis y degradacin normales de protenas celulares (recambio)

    2. Cuando la dieta es rica en protenas ingirindose aa en exceso de las necesidades.

    3. En la inaccin o diabetes, en las que no hay glcidos.

    En estas circunstancias pierden sus grupos aminos y los -cetocidos se oxidan a CO2 y H2O.

  • DESTINO METABLICO DE LOS GRUPOS

    AMINO

    El nitrgeno atmosfrico N2 es abundante pero inerte para su utilizacin en los procesos bioqumicos.

    Pocos M.O pueden convertirse N2 en formas biolgicas tiles como NH3, los grupos amino se utilizan en forma conservadora en los sistemas biolgicos.

    Los aa de la dieta son la fuente de la mayor parte de los grupos amino.

  • DESTINO METABLICO DE LOS GRUPOS

    AMINO

  • DEGRADACIN OXIDATIVA DE LOS

    AMINOCIDOS

    Los aminocidos que se emplean como combustible, siguen 2 caminos:

    Conversin en glucosa (gluconeognesis) Oxidacin a CO2 a travs del CAT Un hombre de 70 kg y una dieta de 2,500 a 3,000 Kcal

    Recambia 400 g diarios de protena 100g se oxida o convierte en glucosa

    6 a 20 g de nitrgeno se excreta por la orina como urea

    Cada protena tiene una determinada vida media

    La vida media depende de su secuencia de aminocidos

    Las enzimas claves tiene una vida media corta (horas)

    La ingesta de un exceso de protenas no conduce a un mayor almacenamiento de aa, sino que se degradan.

  • PROTEOLISIS Degradacin de protenas ingeridas a aa en el tracto

    gastrointestinal.

    La entrada de protenas al estomago estimula a la mucosa gstrica la secrecin de la gastrina.

    La gastrina estimula la secrecin de HCl por las clulas gstricas y pepsingeno, pH 1,5-2,5.

    Las protenas sufren la accin de pepsina en el estmago.

    La pepsina corta cadenas polipeptdicas en pptidos ms pequeos

    Al pasar al intestino el bajo pH ocasiona la secrecin de la secretina a la sangre que estimula al pncreas a secretar bicarbonato.

    La colecistoquinina estimula la secrecin de enzimas pancreticas: quimotripsina, tripsina y carboxipeptidasas en el intestino

    (exocrinos).

    La tripsina libre activa: quimotripsinogeno, procarboxipeptidasa y proelastasa.

    En el hombre la mayor parte de las protenas globulares son degradadas y las fibrosas parcialmente (queratina).

  • OXIDACIN DE LOS AMINOCIDOS Comprende 20 secuencias multienzimtico diferentes que conducen

    al piruvato, a acetil-CoA o intermediarios del CAT.

    La eliminacin del grupo amino es el 1 paso Importancia del Fosfato de piridoxal (B6) en la transferencia de los

    grupos -amino al Glu. Dos rutas principales:

    a) Transaminacin: Ala, Arg. Asp, Asn, Cys, Ile, Leu, Lys, Phe, Trp, Tyr y Val transfieren su grupo amino al carbono de -cetoglutarato (Transaminasas)

    -cetoglutarato + aa Glu + -cetocido (aminotransferasa)

  • OXIDACIN DE LOS AMINOCIDOS b) Desaminacin oxidativa: El Glutamato transaminado, se

    desamina oxidativamente por accin de la glutamato -

    deshidrogenasa (Transdesaminacin)

    L-glu + NAD+ (NADP+) + H2O -cetoglutarato + NH4+ + NADH (NADPH)

    Glutamato deshidrogenasa modulada por ADP (+) y GTP (-)

    Glutamato

    deshidrogenasa

  • RUTAS QUE CONDUCEN AL ACETIL- CoA:

    AMINOCIDOS CETOGNICOS Y GLUCOGNICOS

    Ingresan al CAT

    Ala

    Gly

    Ser

    Thr

    Cys

    Phe

    Tyr

    Leu

    Lys

    Trp

    Ile

    Siguen el CAT o se convierten en glucosa

    Ala

    Gly

    Ser

    Cys

    Thr

  • RUTAS DIRECTAS AL ACETIL- CoA

    10 aminocidos forman Acetil-CoA.

    Entran va piruvato Ala, Gly, Ser, Cys, Trp.

    Provienen del acetoacetil CoA: Phe, Tyr, Leu, Lys, Ile

    y Trp y de ah a la acetil

    CoA

  • RUTAS DIRECTAS AL ACETIL- CoA

  • RUTAS DEL - CETOGLUTARATO

    Se incorporan al CAT, glucognicos

    Arg

    His

    Gln

    Glu

    Pro

  • VIAS CATABLICAS DE LOS

    AMINOCIDOS

  • EXCRECIN DE LOS PRODUCTOS

    NITROGENADOS

    El amonio es txico para las clulas

    El ion amonio, que rebasa las necesidades fisiolgicas se excreta en diversas formas.

    Los peces excretan N2 amnico en forma de amoniaco o urea.

    Los vertebrados terrestres excretan el exceso en forma de urea

    Los pjaros, primates, insectos y reptiles lo convierten en cido rico para eliminarlo

    Formacin de urea en el hgado - ciclo de la urea -

  • CICLO DE LA UREA

    1. El amoniaco (NH3) con el CO2 da fosfato de carbamilo (mitocondria)

    NH4+ + HCO3

    - + 2 ATP + H2O Carbamoilfosfato + 2ADP + Pi (Carbamoil- P- sintetasa)

    2. El fosfato de carbamilo + ornitina da citrulina (mitocondria)

    Carbamoil P + ornitina citrulina + Pi (ornitina transcarbamoilasa)

    3. La citrulina + aspartado + ATP da Argininosuccinato (citoplasma) Citrulina + Aspartato + ATP arginosuccinato + AMP + Pi

    (Argininosuccinatosintetasa)

    4. La argininosuccinato da arginina y fumarato (citoplasma)

    Argininosuccinato Arg + fumarato (Argininosuccinato liasa)

    5. La arginina + agua da urea y ornitina (citoplasma)

    Arginina + H2O urea + ornitina (arginasa)

  • CICLO DE L A UREA

  • CONEXIN DEL CICLO DEL CIDO CTRICO Y

    DE LA UREA

  • INCORPORACIN DEL AMONIACO

    El N reducido a NH4+; puede asimilarse como

    componente de aminocidos y otras molculas.

    La mayor parte de los aminocidos derivan de la amina del Glu.

    El N del grupo amida de la Gln es fuente de grupo amida para una amplia gama de procesos biosintticos.

    El Glu y Gln paso crtico en la incorporacin del N.

    El Glu y el NH4+ dan Gln (Glutamina sintetasa).

    Glu + NH4+ + ATP Gln + ADP + Pi + H+

  • GLUTAMINA SINTETASA

    La Gln sintetasa de las bacterias esta sujeto a la regulacin alostrica y a control por modificacin covalente.

    Tiene 12 unidades identicas

    6 productos del metabolismo de la Gln y Ala y Gly son inhibidores

    Hay inhibicin por adelinilacin de la Tyr por la adenilil transferasa

    La adenilil transferasa regulada por la protena Pii y esta a su vez por la uridilil transferasa.

  • REGULACIN ALOSTRICA DE LA

    Gln SINTETASA

    Tyr adenililado

  • BIOSNTESIS DE AMINOCIDOS

  • BIOSNTESIS DE AMINOCIDOS

  • BIOSNTESIS DE AMINOCIDOS

  • BIOSNTESIS DE LOS AMINOCIDOS

    Los vertebrados no pueden sintetizar todos los aminocidos

    Aminocidos esenciales:

    Leu - Ile

    Thr - Trp

    Val - Lys

    Phe - Met.

    Arg y His en niez

    Treonina y metionina procedentes de la homoserina

    Lisina a partir del cido -diaminopimlico y cido aminoadpico

    Valina, Isoleucina y leucina a partir de -cetobutirato

    Fenilalanina y triptofano a partir de cido shiquimico

    Arginina a partir de ornitina

    Histidina a partir del cido 5- fosforribosil -1- pirofosfato

  • AMINOCIDOS ESENCIALES

  • AMINOCIDOS ESENCIALES

  • AMINOCIDOS ESENCIALES

  • AMINOCIDOS NO ESENCIALES

    Glu, Gln y Pro a partir de - cetoglutarato

    Ser y Gly a partir de 3 - fosfoglicerato

    Cys a partir de Met y Ser

    Tyr a partir de Phe

    Asp, Asn, Ala a partir de cido glutmico

  • SNTESIS DE AMINOCIDOS

  • SNTESIS DE SERINA BIOSNTESIS DE PROLINA BIOSNTESIS DE ARGININA

  • PORFIRINAS

    Glicina precursor del ncleo para los

    grupos hemo:

    Hemoglobina Citocromos Clorofilas

  • PIGMENTOS BILIARES

  • BIOSNTESIS DE CREATININA Y

    FOSFOCREATINA

    Glicina y arginina

    precursores

  • BIOSNTESIS DEL GLUTATION

  • NEUROTRANSMISORES

  • SNTESIS DE NEUROTRANSMISORES

  • SNTESIS DE NEUROTRANSMISORES

  • SNTESIS DE POLIAMINAS

    Derivados de la metionina Rol en el empaquetamiento de ADN

    Las poliaminas han sido relacionadas con procesos fundamentales para la vida, como son la divisin, el crecimiento, la diferenciacin y la muerte celular, habindose demostrado en

    todos los organismos en los que se han conseguido mutantes deficientes en su sntesis

    que las poliaminas son esenciales.

  • GRACIAS