Biobancos en investigación curso oncología
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Desarrollo de investigación oncogenética en Biobanco Plataforma DIO-B MC. MG SANDRO CASAVILCA ZAMBRANO. PATÓLOGO Y LABORATORISTA PATÓLOGO ONCÓLOGO JEFE DE BIOBANCO DEL INSTITUTO NACIONAL DE ENFERMEDADES NEOPLASICAS JEFE DE BIOBANCO DEL INSTITUTO NACIONAL DE ENFERMEDADES NEOPLASICAS
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Desarrollo de investigación oncogenética en Biobanco
Plataforma DIO-B
MC. MG SANDRO CASAVILCA ZAMBRANO.PATÓLOGO Y LABORATORISTA
PATÓLOGO ONCÓLOGO
JEFE DE BIOBANCO DEL INSTITUTO NACIONAL DE ENFERMEDADES NEOPLASICASJEFE DE BIOBANCO DEL INSTITUTO NACIONAL DE ENFERMEDADES NEOPLASICAS
TRASLACIÓN:
CONOCIMIENTO BASADO EN EVIDENCIA
“La transferencia del conocimiento basado en la evidencia dentro de rutina o en la práctica
representativa”
SALUDPÚBLICA
Y PRÁCTICACLÍNICA
Glasgow, R SBM (2005) 26th Annual SBM Meeting, Symposium #22:Disseminating Behavioral Medicine Research: Making the Translational Leap.
INVESTIGACIÓN TRASLACIONAL UNA PERSPECTIVA DESDE LA CIENCIA BÁSICA
• La investigación traslacional es un área de atención por parte de las agencias de financiamiento “GRANTS”.
• Permite ampliar su base de investigación.• Comprende nuevas colaboraciones con colegas clínicos.• Puede comprometer ensayos clínicos o extenderse al uso de muestras de
pacientes o información.
“A los considerados debotos de la ciencia, nada puede hacerlos mas felices que incrementar sus
descubrimientos, pero su felicidad es completa cuando los
resultados de sus estudios encuentran una aplicación
práctica.”
~Louis Pasteur
Our goal is to turn knowledge into applications that benefit people.
Variaciones a nivel de la secuencia del DNA (SNPs, STRs, delecciones, inserciones...)
BIOMARKER
Característica que puede ser medida y evaluada de forma objetiva como un indicador de un proceso biológico normal, proceso
patológico o respuesta farmacológica a una intervención terapéutica
DNA BIOMARKER
Presente en el tejido tumoral o en el suero e incluye diferentes moléculas (DNA, RNA, proteínas...)CANCER
BIOMARKER
Evaluados en el tejido tumoral
Evaluados del tejido tumoral
¿QUÉ ES UN BIOMARCADOR?
BIOMARCADORES EN ONCOLOGÍA
AKERVALL, J., PRUETZ, B. L., GEDDES, T. J., LARSON, D., FELTEN, D. J., & WILSON, G. D. (2013). BEAUMONT HEALTH SYSTEM BIOBANK: A MULTIDISCIPLINARY BIOREPOSITORY AND TRANSLATIONAL RESEARCH FACILITY. BIOPRESERV.BIOBANK., 11(4), 221-228
Instalación multidisciplinaria diseñada para proporcionar
acceso y oportunidad para que los clínicos y científicos orientados a la investigación
se involucren en ella sin necesidad de crear su propia infraestructura, aumentando así los esfuerzos a través del
Sistema de Salud en Investigación
MODELO DE BIOBANCO
MISIÓN
Ser un área sin fines de lucro que brinda y conservamaterial biológico e información asociada a las mismas, con los mayores estándares internacionales de calidad en sus procesos; contribuyendo así en el desarrollo de los proyectos científicos nacionales e internacionales.
OBJETIVO:
Crear y mantener una colección de muestras de tejidos normales y tumorales, recogidas en
óptimas condiciones, para ser utilizados enproyectos de investigación y acercar la
investigación biomédica a resolver problemas clínicos.
AKERVALL, J., PRUETZ, B. L., GEDDES, T. J., LARSON, D., FELTEN, D. J., & WILSON, G. D. (2013). BEAUMONT HEALTH SYSTEM BIOBANK: A MULTIDISCIPLINARY BIOREPOSITORY AND TRANSLATIONAL RESEARCH FACILITY. BIOPRESERV.BIOBANK., 11(4), 221-228 (CONT)
La colección de muestras o “biobanking” ha sido históricamente un esfuerzo
académico o comercial que refleja las ambiciones científicas de la organización o
departamento que lo crea
COLECCIÓN DE MUESTRAS
El “biobanking” implica la recolección, procesamiento y almacenamiento de material biológico, el desarrollo de métodos para preservar su integridad tisular y la
distribución de estas muestras biológicas junto con los datos clínicos relacionados de una forma organizada y confiable para los científicos
AKERVALL, J., PRUETZ, B. L., GEDDES, T. J., LARSON, D., FELTEN, D. J., & WILSON, G. D. (2013). BEAUMONT HEALTH SYSTEM BIOBANK: A MULTIDISCIPLINARY BIOREPOSITORY AND TRANSLATIONAL RESEARCH FACILITY. BIOPRESERV.BIOBANK., 11(4), 221-228 (CONT)
Modelo:
Cuando el análisis de bioespecímenes se debe realizar en instalaciones de laboratorios especializados ubicados en otras partes de la organización, se produce una desconexión entre el análisis y el proceso de “biobanking”.
Esta separación de las funciones de colección, conservación y analíticas incrementa la complejidad y la burocracia de las operaciones y puede resultar en un procesamiento subóptimo de muestras.
INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA CON BIOESPECÍMENES
TOMA DE MUESTRA BANCO DE TEJIDOS TUMORALES
La revista "Time" en 2009 publicó que "el biobanco es una de las diez ideas que cambian el mundo". Con los
avances en tecnología, la demanda de bio-especímenes adecuadamente almacenados y bien conservados ha
aumentado.
REVISTA “TIME”, MARZO 2009
"Los biobancos transformarán la forma en que vemos la enfermedad en desarrollo”
Los médicos y los pacientes están empezando a acoger la idea de recoger muestras de ADN y tejido como parte de los exámenes de rutina
(Rev Times, marzo 2009)
AKERVALL, J., PRUETZ, B. L., GEDDES, T. J., LARSON, D., FELTEN, D. J., & WILSON, G. D. (2013). BEAUMONT HEALTH SYSTEM BIOBANK: A MULTIDISCIPLINARY BIOREPOSITORY AND TRANSLATIONAL RESEARCH FACILITY. BIOPRESERV.BIOBANK., 11(4), 221-228
El objetivo es desarrollar un consentimiento informado amplio donde los donantes acepten cualquier número de estudios futuros que usen
sus muestras o datos, se basa principalmente en dos razones:
(i)simplificar y alentar a los clínicos a involucrarse en el Biobanco, (se alivia la carga de desarrollar una logística), y
(ii)proporcionar la flexibilidad para incorporar nuevas ideas y tecnologías a medida que se desarrollan los proyectos
CONSENTIMIENTO INFORMADO
ORGANIGRAMAORGANIGRAMA BANCO DE TEJIDOS TUMORALESBANCO DE TEJIDOS TUMORALES
EQUIPOS DEL BANCO DE TEJIDOS TUMORALES - INEN
Selección de zonas tumorales Diseño de TMA
Tinción HETinción Ki67
DISEÑO DE TMA
CD8
FOXP-3
6 Intraepith. TIL
0 Intraepith. TIL
2.5X 10X 40X
CHANGING METHODOLOGY: ABSOLUTE NUMBER COUNTING + LYMPHOCYTE SUBTYPES (IHC) IN 5 OR 3 HPF.
Nota: datos registrados de
enero – julio 2017
AÑOS
PROTOCOLOS ANEXOS AL BTTNOMBRE INVESTIGADOR
11 001 HCC TJ IRD DR. BERTANI
11 002 NEURO DR. CASAVILCA
14 001 CITOMETRIA DRA. VIDAL
15 001 CTP6 DRA. NECIOSUP
15 002 MK042 DR. MAS
15 003 OLYMPIA DR. GOMEZ
15 004 MK045 DRA. NECIOSUP
15 005 MK024 DRA. NECIOSUP
15 006 ALIAGA DRA. NECIOSUP
15 007 HP INVEST DR. CASTAÑEDA
15 008 BP GASTRO INVEST DR. CASTAÑEDA
16 001 B3271002 DRA. NECIOSUP
16 002 MAMA INVEST DR. CASTAÑEDA
16 003 BP MAMA INVEST DR. CASTAÑEDA
16 004 G024436 DR. MAS
16 005 EMR100 DR. MAS
16 006 CTC INVEST DR. CASTAÑEDA
16 007 CBYL719 SOLAR DR. MAS
16 008 GINECO INVEST DR. CASTAÑEDA
16 009 GINECO BIOMARCA DR. LOPEZ
16 010 PULMON INVEST DR. CASTAÑEDA
16 011 CM PROTOCOLO DRA. VIDAURRE
16 012 D419AC00003 DRA. VALDIVIEZO
16 013 HP INVEST - SANGRE DR. CASTAÑEDA
16 014 MK3475-119 DR GOMEZ
16 015 COLON INVEST DR. CASTAÑEDA
17 001 Predictores CMTN DR. FUENTES
17 002 PVH INVEST DR. CASTAÑEDA
17 003 TUMORES RAROS BTT DR. CASAVILCA
17 004 CA209227 DR. MAS
Proyectos y Proyectos y protocolos protocolos
vigentes a la vigentes a la fecha fecha
3030
Publicaciones del Banco de TumoresLOGROS
Publicaciones del Banco de TumoresPublicaciones del Banco de TumoresLOGROSLOGROS
Infraestructura y equipamientoInfraestructura y equipamientoLOGROSLOGROS
Capacitaciones de personalCapacitaciones de personalLOGROSLOGROS
Mg. Juan Pablo Cerapio ArroyoBiología Molecular y Doctorado en EpidemiologíaInstituto Pasteur - París, Francia. 2015Instituto Pasteur - París, Francia. 2015
Lic. Dany Córdova MamaniBiobanco y cultivo celularCHU - Centro Hospitalario Universitario de RennesCHU - Centro Hospitalario Universitario de Rennes - Francia. 2015 - Francia. 2015
Lic. Mauricio Ramal MatuteBiología Molecular para detección de MicotoxinasInstituto Nacional de Investigación agrónoma (INRA) -Bordeaux, Francia. 2016Instituto Nacional de Investigación agrónoma (INRA) -Bordeaux, Francia. 2016
Dr. Sandro Casavilca Zambrano Banco de tumores cerebrales y neuropatología quirúrgicaHospital de la Pitié-Salpêtrière – París, Francia. 2017Hospital de la Pitié-Salpêtrière – París, Francia. 2017
Srta. Macarena Farías LozaSrta. Macarena Farías LozaDiplomado en Ética e InvestigaciónDiplomado en Ética e InvestigaciónUniversidad Nacional de TrujilloUniversidad Nacional de TrujilloLima- 2016Lima- 2016
REDES COOPERATIVASREDES COOPERATIVASRed de Biobancos de Latinoamérica y Red de Biobancos de Latinoamérica y
Caribe (REBLAC)Caribe (REBLAC)
BTT miembro de BTT miembro de la REBLACla REBLAC
SHANKAR, S. K. (2015). TIMELESS REVERBERATIONS LET US PROMOTE BIO ‑ BANKING IN INDIA FOR TRANSLATIONAL RESEARCH. NEUROLOGY INDIA / VOLUME 63 / ISSUE 5
Vincular los datos clínicos con las muestras archivadas y su utilización óptima por parte de
los investigadores.
Para comparar los datos científicos generados a partir del tejido tumoral almacenado, existe la necesidad de recolección simultánea de
tejido "relativamente normal" del mismo órgano (preferiblemente pareados por edad y
género)
LA CLAVE DE LOS BIOBANCOS
FELMEISTER, A. S., MASINO, A. J., RIVERA, T. J., RESNICK, A. C., & PENNINGTON, J. W. (2016). THE BIOREPOSITORY PORTAL TOOLKIT: AN HONEST BROKERED, MODULAR SERVICE ORIENTED SOFTWARE TOOL SET FOR BIOSPECIMEN-DRIVEN TRANSLATIONAL RESEARCH. BMC GENOMICS, 17 SUPPL 4(SUPPL 4), 434-434 (CONT)
Los requerimientos de información en las muestras de biorepositorio van en incremento incluyendo cada vez más información clínica y generándose la necesidad de incluir en el proceso mecanismos de
protección de la información de salud (PHI)
BIOBANCO
CANUEL, V., RANCE, B., AVILLACH, P., DEGOULET, P., & BURGUN, A. (2015). TRANSLATIONAL RESEARCH PLATFORMS INTEGRATING CLINICAL AND OMICS DATA: A REVIEW OF PUBLICLY AVAILABLE SOLUTIONS. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 16(2), 280-290
Objetivo:
establecer vínculos entre las caracterizaciones biomoleculares, las
condiciones del paciente, la efectividad del tratamiento y los
efectos adversos, proporcionando al paciente
el mejor tratamiento individual
MEDICINA PERSONALIZADA
CANUEL, V., RANCE, B., AVILLACH, P., DEGOULET, P., & BURGUN, A. (2015). TRANSLATIONAL RESEARCH PLATFORMS INTEGRATING CLINICAL AND OMICS DATA: A REVIEW OF PUBLICLY AVAILABLE SOLUTIONS. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 16(2), 280-290 (CONT)
Las plataformas de investigación traslacional deben ser capaces de combinar el flujo de trabajo de los investigadores para un uso óptimo. Por lo tanto, deben proporcionar:
(i) el almacenamiento e integración de datos clínicos y de los ómicos;
(ii) un marco de análisis que permita a los científicos explorar sus datos y generar hipótesis;
(iii)información cruzada adicional de bases de datos externas (por ejemplo, enlace a una descripción de genes específica en la literatura publicada o bases de datos públicas)
MEDICINA PERSONALIZADA
CANUEL, V., RANCE, B., AVILLACH, P., DEGOULET, P., & BURGUN, A. (2015). TRANSLATIONAL RESEARCH PLATFORMS INTEGRATING CLINICAL AND OMICS DATA: A REVIEW OF PUBLICLY AVAILABLE SOLUTIONS. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 16(2), 280-290 (CONT)
INVESTIGACIÓN PSIQUIATRICA Y NEUROLÓGICA
• Ejemplos• Los estudios patológicos moleculares han identificado genes que son factores causales
o de riesgo, o ambos, en la enfermedad de Alzheimer, la enfermedad de Huntington y la enfermedad de la motoneurona.
• La recolección sistemática de cerebros de pacientes que han muerto de SIDA ha demostrado que la pérdida neuronal sólo se asocia con la fase sintomática de la enfermedad.
Las nuevas técnicas desarrolladas los bancos cerebrales han producido nuevos conocimientos sobre la comprensión de la
patogénesis de los transtornos psiquiátricos y neurológicos, así como han generado una esperanza real de mejorar el tratamiento.
BALDO, C., CASARETO, L., RENIERI, A., MERLA, G., GARAVAGLIA, B., GOLDWURM, S., … FILOCAMO, M. (2016). THE ALLIANCE BETWEEN GENETIC BIOBANKS AND PATIENT ORGANISATIONS: THE EXPERIENCE OF THE TELETHON NETWORK OF GENETIC BIOBANKS. ORPHANET JOURNAL OF RARE DISEASES, 11
El término enfermedades raras (RD) se refiere a aproximadamente 5000-8000 enfermedades que afectan a un estimado de 350 a 400 millones de personas en
todo el mundo.
Debido a que las RD afectan a un número limitado de individuos (6-8% de la población), a menudo se descuidan.
ENFERMEDADES RARAS
La participación de las organizaciones de pacientes (OP) de RD es esencial si se desea obtener una masa crítica de muestras, ya que las OP pueden servir de enlace entre
los biobancos genéticos (GB) y los médicos, para recoger muestras y datos clínicos para la investigación.
NNTC
• En 1998 se funda el “National NeuroAIDS Tissue Consorcium” (NNTC) en respuesta a la necesidad de la comunidad científica de contar con tejido y fluidos del sistema nervioso central y periférico, de individuos infectados por el VIH, compartiendo protocolos y base de datos.
Morgello, S., Gelman, B. B., Kozlowski, P. B., Vinters, H. V., Masliah, E., Cornford, M., … Singer, E. J. (2001). The National NeuroAIDS Tissue Consortium: A new paradigm in brain banking with an emphasis on infectious disease. Neuropathology and Applied Neurobiology, 27(4), 326-335
OPEN SCIENCE
• El Instituto Neurológico de Montreal (Neuro) anunció en la primavera de 2016 que está lanzando un experimento de cinco años durante el cual adoptará la política de Ciencia Abierta -
datos abiertos, materiales abiertos y sin patentes.
Gold, E. R. (2016). Accelerating Translational Research through Open Science: The Neuro Experiment. PLoS Biology, 14(12), 1-7
HUTTIN, C., & STUBBS, A. (2016). A CONTRIBUTION FOR COST MODELS IN BIOBANKING. TECHNOLOGY AND HEALTH CARE, 24(1), 93-98 (CONT)
La mayoría de los modelos de costos convencionales utilizados
en los hospitales han sido modelos de recuperación de costos,
basados en una personalización de las tareas correspondientes a la
preparación y el uso de bioespecímenes
ECONOMÍA DE LA SALUD
HUTTIN, C., & STUBBS, A. (2016). A CONTRIBUTION FOR COST MODELS IN BIOBANKING. TECHNOLOGY AND HEALTH CARE, 24(1), 93-98 (CONT)
Los tipos de costos suelen clasificarse como:
- costos de adquisición,
- costos de revisión de patología / histología,
- costos de documentación de consentimiento informado,
- costos de recolección de datos,
- costos de seguros,
- costos de equipo, manejo y transporte, o
- costos de mensajería y envio.
ECONOMÍA DE LA SALUD
HUTTIN, C., & STUBBS, A. (2016). A CONTRIBUTION FOR COST MODELS IN BIOBANKING. TECHNOLOGY AND HEALTH CARE, 24(1), 93-98 (CONT)
Este artículo destaca el desarrollo potencial de nuevos modelos de costos, utilizando ejemplos de dos formas organizativas:
plataformas de tecnología adaptativa, con el fin de establecer pasos en el traslado del procesamiento de
bioespecímenes de laboratorio a la práctica clínica y de nuevo al laboratorio que requieren protocolos de calidad para que los bioespecímenes puedan ser usados apropiadamente tanto por
investigadores como por clínicos.
ECONOMÍA DE LA SALUD
HUTTIN, C., & STUBBS, A. (2016). A CONTRIBUTION FOR COST MODELS IN BIOBANKING. TECHNOLOGY AND HEALTH CARE, 24(1), 93-98 (CONT)
ECONOMÍA DE LA SALUD
GRACIAS
Los bancos de tumores se han creado para obtener, clasificar, conservar y distribuir muestras de tejidos y muestras biológicas para la investigación de enfermedades en contextos éticos muy precisos, siendo un reto para nuestra región el promover y desarrollar una red de biobancos que permita contar con material de estudio en diversos padecimientos en nuestra población.
