GENETICA2011

PARTE II: HERENCIATeorica 7

MAPA DE LIGAMIENTO DEL CR 1 HUMANO

Un valor de 1 % de recombinación o entrecruzamiento significa que los genes están

ubicados a una distancia expresada en una unidad llamada centimorgan o una unidad de

mapa del mismo cromosoma

COMO SABER SI GENES ESTAN LIGADOS?PROGENIE RECOMBINANTE Y NO-RECOMBINANTE

A1 y A2 son 2 posibles marcadores de la

enfermedad

En que orden están los genes en un mismo cromosoma?Cruzamientos de 3 puntos

Datos:3 loci ligados (abc).La combinacion menos frecuentes sera la q requiera 2 eventos de CODe 1000 descendientes: 142 sufrieron CO entre a y b . 52 sufrieron CO entre a y c

100 sufrieron Co entre b y c5 sufrieron CO entre a y c

ENTONCES:

•El orden de los genes es a-c-b•Las distancias aproximadas son:

a (5cM)-c-(10cM)-b

MARCADORES MOLECULARES

GENOTIPO FENOTIPO

•GENES•AMBIENTE

MARCADORES MOLECULARES

•RFLP•VNTR

•RAPDs•STRs•AFLP

Permiten evidenciar variaciones en la secuencia de ADN entre 2 individuos distintos y asociarlos con un rasgo fenotipico

Deben ser:Altamente polimorficosNo epistasicosPoco efecto ambiental

ANTES DE SEGUIR, PREGUNTAR:

SABEN LO QUE ES PCR?

RAPDs

AFLP

LOS MARCADORES MOLECULARES SE PUEDEN CONVERTIR EN MARCADORES “PCR ALELO ESPECIFICOS” (STS: sequence tagged sites)(economicos, robustos, sencillos)

Se aisla fragmento

polimorfico de un gel

Se clona Se secuencia Se disenan primers para

esas secuencias

EST: expressed sequence tags

STS (sequence-tagged sites) y EST (expressed sequence tags)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?term=dbEST

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?term=dbEST

NCBI de USA (GenBank)

EBI de EU (EMBL Nucleotide Seq database)

DDBJ de Japon

SwissProt

BASES DE DATOS GENERALES

BIO-INFORMATICA

BIO-INFORMATICA

BUSCADOR ENTREZ

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery

ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi